当不能明确漏水原因时，起诉谁需分情况讨论，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、从相邻关系角度分析
根据《民法典》第二百八十八条规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。在房屋漏水纠纷中，若您认为楼上住户的漏水行为导致了您的损失，您需要证明损害事实与对方行为之间的因果关系。
若能初步证明与楼上有关：
- 例如，您发现楼上住户的卫生间、厨房等区域存在漏水迹象，且您的房屋受损部位与楼上漏水区域相对应，此时您可以起诉楼上住户。
- 在诉讼过程中，若楼上住户否认漏水与其有关，或双方对漏水原因存在争议，法院可能会委托专业机构进行鉴定。若鉴定结果显示漏水确实与楼上住户有关，楼上住户应承担相应的赔偿责任。
若无法证明与楼上有关，或楼上也受害：
- 例如，楼上住户也表示其房屋存在漏水情况，且可能是更高楼层或公共区域漏水所致，此时情况会更为复杂。
- 在这种情况下，若无法明确漏水原因，且双方均不愿承担鉴定费用或鉴定费用过高，法院可能会根据《民法典》第一千一百八十六条的规定，即“受害人和行为人对损害的发生都没有过错的，依照法律的规定由双方分担损失”，来酌情判决双方分担损失。
二、从物业管理角度分析
若漏水原因可能与物业管理的公共区域或设施有关，如公共管道、屋顶等，您也可以考虑起诉物业公司。
若漏水源于公共区域：
- 例如，公共管道破裂导致漏水，或屋顶防水层老化导致渗水，此时物业公司作为公共区域的管理者，应承担相应的维修和赔偿责任。
- 您需要收集相关证据，如照片、视频、物业维修记录等，以证明漏水与公共区域有关，并起诉物业公司要求其承担赔偿责任。
若物业公司未尽到管理职责：
- 即使漏水原因不明确，但若您能证明物业公司未尽到对公共区域的管理和维修职责，如未定期检查公共管道、未及时维修屋顶等，导致漏水情况发生或加重，物业公司也可能需要承担一定的责任。
三、法律建议
收集证据：
- 在起诉前，您应尽可能收集与漏水相关的证据，如照片、视频、社区或派出所的记录等，以证明损害事实和可能的漏水原因。
考虑鉴定：
- 若双方对漏水原因存在争议，且无法通过协商解决，您可以考虑申请法院委托专业机构进行鉴定。但需注意，鉴定费用可能较高，且鉴定结果不一定能完全明确漏水原因。
咨询专业律师：
- 在起诉前或诉讼过程中，您可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为专业律师，我可以根据您的具体情况提供针对性的法律服务。
尝试调解：
- 在起诉前或诉讼过程中，您也可以尝试通过社区调解、人民调解委员会等途径进行调解，以寻求更快速、经济的解决方案。
当不能明确漏水原因时，起诉谁需根据具体情况和证据来判断。若您在此方面遇到困难或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。