核心结论：土地出售协议被法院判决无效后，地上附属物的认定需结合附属物的性质、形成时间、双方约定及实际贡献等因素综合判断，具体处理方式可能因个案差异而有所不同。以下是详细分析：

1. 附属物性质与形成时间

• 若附属物为原土地使用权人所有：例如土地出售前已存在的房屋、树木等，协议无效后，附属物原则上应归原权利人所有。但需注意，若出售方在协议中明确放弃附属物权利，或买方对附属物形成有重大贡献（如出资改建），可能影响归属。
• 若附属物为买方新增：例如买方在土地使用期间新建的厂房、设施等，需区分是否构成“添附”。根据《民法典》第三百二十二条，添附物的归属应按照合同约定；无约定的，按照发挥物效用的原则确定，通常由买方取得所有权，但需补偿原土地使用权人土地价值损失。

2. 双方约定与合同条款

• 若协议中明确约定了附属物的归属（如“土地及地上附属物一并转让”），即使协议无效，该条款也可能作为参考。但需注意，无效合同自始无效，条款效力需结合《民法典》第一百五十七条判断，即返还财产或折价补偿。
• 若协议未约定，则需依据法律规定和公平原则处理。例如，买方可能需返还土地，但可要求出售方补偿附属物价值（如建设成本、折旧等）。

3. 实际贡献与公平原则

• 法院在判决时会考虑双方对附属物的实际贡献。例如，若买方出资建设了附属物，而出售方未提供任何帮助，法院可能倾向于判令附属物归买方所有，但要求买方支付土地使用费或补偿出售方损失。
• 反之，若附属物为出售方原有财产，买方仅进行了简单修缮，则附属物可能归出售方所有，买方仅能要求返还修缮费用。

4. 程序与证据要求

• 无论附属物归属如何，双方均需提供证据支持主张。例如，买方需提供建设合同、付款凭证等证明其对附属物的投入；出售方需提供土地权属证明、附属物原始状态证据等。
• 若双方无法协商一致，可通过诉讼或仲裁解决。法院可能委托评估机构对附属物价值进行鉴定，作为判决依据。

5. 特殊情形处理

• 政府征收或拆迁：若协议无效期间遇政府征收，附属物补偿款可能按“谁投入、谁受益”原则分配，但需结合征收政策具体判断。
• 恶意串通情形：若协议因恶意串通被认定无效，附属物可能被收归国有或返还真正权利人，双方均不得主张权利。

建议：若您涉及此类纠纷，建议尽快收集相关证据（如合同、付款记录、附属物现状照片等），并咨询专业律师分析具体案情。不同案件中，附属物的认定可能因细节差异而结果不同，需结合个案事实综合判断。如有进一步问题，可直接向我提问。