当农村土地买卖合同被认定无效时，地上附属物的判决主要依据“房地一体”原则、过错责任原则以及公平原则来综合判定。以下是具体分析：

1. “房地一体”原则下的归属判定
   根据《民法典》第357条，建筑物、构筑物及其附属设施转让时，其占用范围内的建设用地使用权一并处分。若土地买卖合同无效，但地上附属物（如房屋、大棚等）系买方独立出资建造，法院可能基于“房地分离”的特殊情形，判决附属物归买方所有，土地使用权恢复原状归卖方。但需注意，若附属物与土地不可分割（如地基与土地紧密结合），法院可能判决整体返还，由买方拆除附属物并恢复土地原状，或通过折价补偿方式处理。

2. 过错责任原则下的补偿分配
   法院会审查合同无效的过错方：

   • 若卖方明知土地禁止买卖（如宅基地、耕地）仍签订合同，需承担主要过错，可能需赔偿买方建造附属物的合理支出（如材料费、人工费）；
     
   • 若买方明知土地性质仍购买，需自行承担部分损失；
     
   • 若双方均有过错，法院可能按比例分担损失，例如卖方赔偿60%、买方自担40%。

3. 公平原则下的折价补偿
   若附属物已与土地形成长期依附关系（如种植多年的果树），强制拆除可能导致资源浪费，法院可能依据《民法典》第157条，判决卖方折价补偿买方附属物的现存价值，同时土地使用权归卖方。补偿标准通常参考市场评估价或双方协商价。

实务建议：

• 合同无效后，双方应优先协商处理附属物归属，避免扩大损失；
  
• 若协商不成，买方需保留建造附属物的支出凭证（如发票、合同），以便主张补偿；
  
• 卖方需注意，若附属物存在安全隐患或违反规划（如违规搭建），可能面临行政处罚，需及时整改。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料提供更精准的分析。