当您在单位申报工伤认定后，遇到单位不配合做笔录的情况，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

一、自行收集证据并申请工伤认定

1. 证据收集：

   • 尽可能收集能证明您与单位存在劳动关系以及工伤事实的证据，如劳动合同、工资发放记录、工作证、考勤记录、工友证言、工作场景照片、医院诊断记录等。
   • 这些证据在工伤认定过程中至关重要，它们能够支持您的工伤认定申请。

2. 申请工伤认定：

   • 根据《工伤保险条例》的规定，您或您的近亲属、工会组织可以在规定时间内（通常是事故伤害发生之日起1年内），直接向用人单位所在地统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 提交申请时，请附上您收集到的所有相关证据，并详细说明单位不配合做笔录的情况。

二、依靠社会保险行政部门的调查核实

1. 部门调查：

   • 社会保险行政部门在受理您的工伤认定申请后，会依职权进行调查核实。
   • 即使单位不配合提供材料或做笔录，社会保险行政部门也会根据您提供的证据以及自身的调查核实情况，作出工伤认定结论。

2. 单位举证责任：

   • 在工伤认定程序中，如果单位认为不是工伤，那么单位需要承担举证责任。
   • 如果单位逾期未举证或举证不能，社会保险行政部门将根据您提供的证据及调查情况作出工伤认定结论，单位可能需承担不利后果。

三、维护自身权益的后续措施

1. 对认定结论不服的救济途径：

   • 如果您对社会保险行政部门作出的工伤认定结论不服，可以在规定时间内申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 这是维护您自身合法权益的有效法律途径。

2. 与单位协商赔偿：

   • 在工伤认定结论作出后，您可以就工伤赔偿事宜与单位进行协商。
   • 如果协商不成，您可以通过劳动仲裁要求单位承担相应的赔偿责任。
   • 在仲裁过程中，您可以依据前期收集的证据主张自己的权益。

四、寻求专业帮助

• 如果您在工伤认定过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业法律人士的帮助。
• 他们可以根据您的具体情况提供更精准、更有效的建议和帮助，助您顺利解决工伤认定难题。

总之，当单位不配合做笔录时，您不必过于担忧。通过自行收集证据、申请工伤认定、依靠社会保险行政部门的调查核实以及维护自身权益的后续措施，您可以有效地维护自己的合法权益。同时，寻求专业帮助也是一个明智的选择。