出租车司机被乘客殴打，且乘客是同行并二次打人，应根据具体伤情鉴定结果及案件性质，由公安机关依法对打人者进行行政处罚或追究刑事责任。以下是对此情况的具体分析：

一. 行政处罚

1. 一般情形：如果乘客的殴打行为未造成出租车司机轻伤或以上的伤害，那么该行为通常被视为违反治安管理的行为。根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，公安机关可以对打人者进行行政处罚，如警告、罚款、拘留等。
2. 加重情形：考虑到乘客是同行且二次打人，这可能被视为情节较重或恶劣的情形。在此情况下，公安机关可能会对打人者处以更重的行政处罚，如更长时间的拘留或更高的罚款。

二. 刑事处罚

1. 轻伤或以上：如果乘客的殴打行为导致出租车司机轻伤或以上的伤害，那么该行为可能构成故意伤害罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百三十四条的规定，故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。
2. 二次打人：二次打人的行为可能被视为累犯或情节恶劣，这可能会影响刑罚的轻重。在刑事审判中，法院会综合考虑案件的所有情况，包括打人者的动机、手段、后果以及是否累犯等因素，来判定具体的刑罚。

三. 民事赔偿 无论打人者是否受到行政处罚或刑事处罚，出租车司机都有权要求其承担民事赔偿责任。这包括赔偿因殴打行为导致的医疗费、误工费、精神损失费等合理费用。

我建议，出租车司机在遭遇此类事件时，应首先确保自身安全，并及时报警。在报警后，积极配合公安机关的调查和处理工作。同时，也可以考虑咨询专业律师，以便更好地了解自己的权益和可能的法律途径。如有进一步需要，您可以继续咨询我。