没有合法来源的国有建设用地，一般不能作为历史遗留问题登记发证。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律原则与规定

1. 合法来源原则：

   • 国有建设用地的取得和使用必须遵循法律法规，确保土地来源的合法性。这是土地管理的基本原则，也是保障土地市场秩序和公共利益的重要基础。

2. 登记发证条件：

   • 土地登记发证是土地管理的重要环节，旨在确认土地权属，保护土地权利人的合法权益。根据相关法律法规，申请土地登记发证必须提供合法有效的土地权属来源证明。没有合法来源的国有建设用地，无法满足这一基本条件。

二、历史遗留问题的处理

1. 历史遗留问题的界定：

   • 历史遗留问题通常指的是由于历史原因造成的、在现行法律法规框架下难以直接解决的问题。对于这类问题，政府往往会出台相应的政策或规定，以妥善解决历史遗留问题，维护社会稳定和公共利益。

2. 历史遗留问题与登记发证的关系：

   • 即使对于历史遗留问题，政府在处理时也会遵循合法、公正、公平的原则。没有合法来源的国有建设用地，即使属于历史遗留问题，也不应成为登记发证的例外。政府可能会通过其他方式（如补办手续、完善权属证明等）来解决这类问题，但绝不会直接违反法律法规进行登记发证。

三、可能的法律后果

1. 无效登记：

   • 如果对没有合法来源的国有建设用地进行登记发证，该登记行为可能因违反法律法规而被认定为无效。这将导致土地权属的不确定性和法律纠纷的增加。

2. 法律责任：

   • 相关责任人员可能因违反法律法规而承担法律责任，包括行政责任、民事责任甚至刑事责任。这将严重影响个人声誉和职业生涯。

四、建议与措施

1. 完善权属证明：

   • 对于没有合法来源的国有建设用地，应尽快完善权属证明，确保土地来源的合法性。这可以通过补办相关手续、提供历史资料等方式来实现。

2. 咨询专业律师：

   • 在处理这类复杂问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供法律建议和解决方案，帮助当事人合法、有效地解决问题。不过，作为许学斌律师，我可以直接为你提供这方面的法律咨询，你有问题可以直接向我咨询。

3. 关注政策动态：

   • 政府可能会出台相关政策或规定来处理历史遗留问题。因此，关注政策动态、及时了解相关信息对于解决问题至关重要。