针对您提出的“内部人员违规办理毕业证书怎么处理”的问题，这是一个涉及教育法规和学校管理的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，内部人员违规办理毕业证书是严重违反教育法规和学校规章制度的行为。这种行为不仅损害了教育的公平性和公正性，也破坏了学校的声誉和学术环境。

一、处理原则

1. 依法依规：处理此类问题必须严格遵循国家相关法律法规和学校规章制度，确保处理的合法性和公正性。
2. 严肃处理：对于违规行为，应给予严肃的纪律处分，以儆效尤，维护教育的严肃性和权威性。
3. 教育为主：在处理过程中，应注重对违规人员的思想教育和引导，帮助他们认识到错误的严重性，并改正错误。

二、具体处理措施

1. 调查核实：一旦发现内部人员违规办理毕业证书的情况，学校应立即成立专门调查组，对事件进行全面、客观的调查核实。
2. 宣布证书无效：根据《中华人民共和国教育法》第八十二条的规定，对于违规颁发的毕业证书，教育行政部门或其他有关行政部门应宣布证书无效，并责令收回或予以没收。
3. 没收违法所得：如果违规行为涉及经济利益，如收取费用等，应依法没收违法所得。
4. 纪律处分：根据违规情节的严重程度，对违规人员给予相应的纪律处分，如警告、记过、降级、撤职、开除等。对于情节特别严重的，还可以依法追究其法律责任。
5. 整改与预防：学校应针对此类问题开展专项整改，完善相关规章制度，加强内部管理和监督，防止类似问题再次发生。

三、后续跟进

1. 公开通报：对于处理结果，学校可以在一定范围内进行公开通报，以起到警示和教育作用。
2. 加强教育：通过开展专题教育、培训等活动，提高全体人员的法律意识和纪律观念，增强他们的责任感和使命感。
3. 持续监督：建立长效监督机制，定期对学校各项工作进行检查和评估，确保各项规章制度得到有效执行。

综上所述，内部人员违规办理毕业证书是严重违反教育法规和学校规章制度的行为，必须给予严肃处理。学校应依法依规进行调查核实、宣布证书无效、没收违法所得、给予纪律处分，并加强整改与预防工作，以维护教育的公平性和公正性。