纪检部门拒绝书面回复可能违反的规定，需根据具体情况及纪检部门的性质和层级来判断，以下是一些可能涉及的规定：

1. 《中国共产党纪律检查机关控告申诉工作条例》的相关规定：

   • 若纪检部门为党的纪律检查机关，且涉及的是党员或党组织的控告申诉，那么根据《中国共产党纪律检查机关控告申诉工作条例》，纪检部门有义务对控告申诉进行认真处理，并在规定时间内给予答复。若纪检部门无正当理由拒绝书面回复，可能违反了该条例中关于处理控告申诉的程序性规定。具体来说，该条例要求纪检机关对控告申诉进行登记、分类摘要，并按规定程序处理，对于重要、紧急的控告申诉应当及时处理，不得延误。虽然条例未直接规定“必须书面回复”，但要求处理并答复的义务隐含了回复的形式和及时性要求，拒绝书面回复可能构成对处理程序的违反。

2. 《中华人民共和国监察法》及其实施条例的相关规定：

   • 若纪检部门同时承担监察职能（如纪检监察合署办公的情况），则还需考虑《中华人民共和国监察法》及其实施条例。这些法规规定了监察机关对职务违法和职务犯罪的调查、处置程序，包括受理检举控告、进行调查核实、作出处置决定等。虽然这些法规主要关注的是调查和处置程序，但并未直接规定必须书面回复检举控告人。然而，从保障公民知情权和监督权的角度出发，监察机关在处理检举控告时，应当遵循公正、公平、公开的原则，及时告知处理结果。若纪检部门（作为监察机关的一部分）无正当理由拒绝书面回复，可能间接违反了这些原则性要求。

3. 内部管理规定或工作纪律：

   • 除了上述法律法规外，纪检部门还可能受到其内部管理规定或工作纪律的约束。这些规定或纪律可能明确要求纪检部门在处理控告申诉或检举控告时，必须给予书面回复。若纪检部门违反了这些内部规定或纪律，虽然不直接构成对外部法律法规的违反，但可能受到内部纪律处分。

法律建议与后果分析：

• 对于控告申诉人或检举控告人：若认为纪检部门拒绝书面回复的行为侵犯了其合法权益，可以向上级纪检部门或相关监督机构进行投诉或举报。在投诉或举报时，应提供充分的证据材料，以证明纪检部门的行为确实违反了相关规定或纪律。
• 对于纪检部门：应严格遵守相关法律法规和内部管理规定，确保在处理控告申诉或检举控告时，给予及时、准确的书面回复。若因特殊原因无法及时回复，应向控告申诉人或检举控告人说明情况，并尽快给予回复。否则，可能面临内部纪律处分或外部监督机构的调查。

具体行动建议：

• 若您作为控告申诉人或检举控告人遇到此类情况，建议首先与纪检部门进行沟通，了解其拒绝书面回复的具体原因。
• 若沟通无果，您可以向上级纪检部门或相关监督机构进行投诉或举报，并提供充分的证据材料。
• 在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。

有问题可以直接向我咨询，我会结合具体案情和法律法规，为您提供专业的法律意见。