离职协议公司只签字按手印，通常是有效的。以下从不同角度为你详细分析：

法律规定层面

根据《民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在这里，签字、盖章、按指印具有同等的法律效力。所以，如果公司法定代表人或负责人在离职协议上签字并按了手印，这通常可以代表公司的真实意愿，协议一般是有效的。

协议约定层面

不过，具体还要结合离职协议中的实际约定来判断。如果协议里明确规定了必须同时签字和盖章才生效，那么只签字按手印而未盖章，可能会导致协议不生效。这种情况下，就需要严格按照协议的约定来执行。

实际案例参考

举个例子，小朱从公司离职时，与公司签订了离职协议书。公司在协议上仅由法定代表人签字并按了手印，未加盖公章。小朱认为协议未盖章应不生效，而公司则称签字和按手印代表公司真实意思，协议有效，双方因此产生了争议。从这个案例可以看出，即使没有盖章，只要签字和按手印能代表公司真实意愿，且协议没有特殊约定，协议通常是有效的。

建议与注意事项

• 明确生效条件：为了避免类似的纠纷，建议在离职协议中明确约定生效条件，比如是签字即生效，还是需要同时签字和盖章才生效。
• 留存协议原件：无论是劳动者还是公司，都应该留存好离职协议的原件，以备不时之需。
• 及时咨询：如果在离职协议的签订或执行过程中遇到任何问题，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。

总的来说，离职协议公司只签字按手印，在大多数情况下是有效的，但也要结合协议的具体约定和实际情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。