结论：公司要求员工自行完成个税申报是否合法，需分情况讨论。

1. 若公司仅要求员工自行申报，但未强制干预申报内容或流程
   根据《个人所得税法》及实施条例，纳税人（即员工）负有自行申报个税的法定义务，公司无权代为申报，但可协助提供收入数据等必要信息。若公司仅要求员工通过“个人所得税”APP等官方渠道自行完成申报，未设置不合理限制或干预申报内容，此行为合法。
   法律依据：《个人所得税法》第十条明确，纳税人需自行办理纳税申报，或委托他人代为办理。

2. 若公司强制要求员工通过特定方式申报，或干预申报内容
   若公司要求员工必须通过公司指定系统申报，或要求员工在申报中虚报、瞒报收入（如要求员工将部分收入拆分为“报销”等非税项目），则涉嫌违法。
   法律依据：

   • 《税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿等行为，构成偷税，需承担补缴税款、滞纳金及罚款责任；
     
   • 《刑法》第二百零一条，偷税数额较大且占应纳税额10%以上的，可能构成逃税罪，公司相关责任人可能被追究刑事责任。

3. 若公司以“自行申报”为由逃避代扣代缴义务
   根据《个人所得税法》第十一条，公司作为支付方，负有代扣代缴义务（如工资薪金所得）。若公司要求员工自行申报，但未履行代扣代缴义务，导致员工漏缴税款，公司需承担补缴税款、滞纳金及罚款责任。
   例外情形：若员工收入属于“综合所得”外的其他所得（如劳务报酬、稿酬等），且未达到起征点，公司可能无需代扣代缴，但需向员工说明申报要求。

建议：

• 若公司仅要求员工自行申报，且未干预申报内容，员工可按流程完成申报；
  
• 若公司要求虚报、瞒报收入，或以“自行申报”为由逃避代扣代缴义务，员工可向税务机关举报（举报电话12366）；
  
• 员工可要求公司提供收入明细（如工资条、奖金单等），确保申报数据准确。
  

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