在抖音上诽谤他人，最终由谁来处罚，需根据诽谤行为的性质、情节严重程度以及社会影响等因素，由不同的执法机关或司法机关进行处罚。具体分析如下：
1. 民事责任
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，任何组织或者个人不得以侮辱、诽谤等方式侵害他人的名誉权。若行为人实施了诽谤行为，导致他人社会评价降低，受害人可请求停止侵害、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉，并可要求赔偿精神损害。
- 处罚主体：民事责任主要由侵权人承担，受害人可通过民事诉讼途径，要求侵权人承担相应的民事责任。
2. 行政责任
- 法律依据：根据《治安管理处罚法》的相关规定，公然侮辱他人或者捏造事实诽谤他人的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款；情节较重的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款。
- 处罚主体：行政责任由公安机关进行处罚。若行为人的诽谤行为构成违反治安管理行为，公安机关将依法对其进行行政处罚。
- 情节较重的认定：包括使用恶劣手段、方式；给他人正常工作、生活、身心健康、名誉造成较大影响；经劝阻仍不停止；利用信息网络公然侮辱、诽谤他人；针对多人实施；以及其他情节较重的情形。
3. 刑事责任
- 法律依据：根据《刑法》的相关规定，以暴力或其他方法公然侮辱他人或捏造事实诽谤他人，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利。本罪为自诉案件，但严重危害社会秩序或国家利益的，可转为公诉。
- 处罚主体：刑事责任由司法机关进行处罚。若行为人的诽谤行为构成犯罪，司法机关将依法对其进行刑事处罚。
- 情节严重的认定：包括二年内曾因诽谤受过行政处罚，又诽谤他人的；以及引发群体性事件或公共秩序混乱、造成恶劣国际影响、损害国家形象或国家利益等严重危害社会秩序的情形。
4. 网络平台责任
- 法律依据：根据《网络安全法》的相关规定，网络平台有义务及时删除违法信息，否则可能被网信部门责令改正或处罚。
- 责任主体：若抖音等网络平台未及时删除诽谤他人的侵权内容，可能承担连带责任。
实务建议
- 及时取证：使用截图、录屏等方式保存侵权内容，记录发布时间、传播范围（如点赞、转发量），并通过公证或区块链存证技术增强证据效力。
- 向平台投诉：向抖音等平台投诉，要求删除侵权内容，并保存证据通知侵权人停止侵害。
- 向公安机关报案或向网信办举报：若行为人的诽谤行为构成违反治安管理行为或犯罪，可向公安机关报案或向网信办举报。
- 民事诉讼或刑事自诉：根据情节严重程度，可选择向法院提起民事诉讼主张名誉权侵权赔偿，或向法院提起刑事自诉追究行为人的刑事责任。
在抖音上诽谤他人，可能涉及民事责任、行政责任、刑事责任以及网络平台责任。具体由谁来处罚，需根据诽谤行为的性质、情节严重程度以及社会影响等因素进行综合判断。若您遇到此类问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。