事业单位工作人员行为不当的处理方式及依据条款，需根据行为性质、后果及单位内部规定综合判断，具体如下：

一、处理方式

1. 内部纪律处分
   事业单位通常依据《事业单位工作人员处分暂行规定》（人社部、监察部令第18号）对工作人员的违规行为进行处分。处分种类包括警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除。例如，若工作人员存在旷工、工作态度恶劣、违反工作程序等行为，单位可根据情节轻重给予相应处分。

2. 行政处罚或刑事追责
   若行为违反《治安管理处罚法》或构成犯罪（如贪污、受贿、滥用职权等），需移交公安机关或司法机关处理。例如，工作人员利用职务之便收受财物，可能涉嫌受贿罪，需承担刑事责任。

3. 民事赔偿
   若行为造成单位或他人财产损失，单位可依据《民法典》要求工作人员承担民事赔偿责任。例如，工作人员因过失导致单位设备损坏，需赔偿修复费用。

二、依据条款

1. 《事业单位工作人员处分暂行规定》

   • 适用范围：规范事业单位工作人员的违规行为处分。
     
   • 关键条款：
     
     • 第五条：处分的种类为警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除。
       
     • 第六条至第十六条：明确违规行为的具体情形（如违反政治纪律、工作纪律、廉洁纪律等）及对应处分。
       
     • 第二十二条：单位需将处分决定存入受处分人档案，并报同级事业单位人事综合管理部门备案。

2. 《中华人民共和国公职人员政务处分法》

   • 适用范围：对事业单位中公职人员的政务处分。
     
   • 关键条款：
     
     • 第三条：明确公职人员包括事业单位工作人员。
       
     • 第七条至第二十九条：规定政务处分的种类（警告、记过、记大过、降级、撤职、开除）及适用情形（如贪污贿赂、滥用职权、玩忽职守等）。
       
     • 第四十条：单位需依法作出政务处分决定，并通知受处分人及其所在单位。

3. 《中华人民共和国刑法》

   • 适用范围：若行为构成犯罪，需追究刑事责任。
     
   • 关键条款：
     
     • 第三百八十五条（受贿罪）：国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物或非法收受他人财物，为他人谋取利益的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
       
     • 第三百九十七条（滥用职权罪、玩忽职守罪）：国家机关工作人员滥用职权或玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或拘役。

三、处理流程

1. 调查核实：单位需对行为进行调查，收集证据（如证人证言、监控录像、书面材料等）。
   
2. 听取陈述：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第二十一条，单位应听取被调查人的陈述和申辩，并记录在案。
   
3. 作出决定：单位根据调查结果，依据内部规定或法律法规作出处分决定。
   
4. 通知与执行：将处分决定通知受处分人，并执行处分（如扣发工资、调整岗位等）。
   
5. 申诉与复核：受处分人若不服，可按《事业单位工作人员处分暂行规定》第三十九条申请复核或申诉。

四、注意事项

• 程序合法性：单位处理行为时需严格遵守法定程序，避免因程序违法导致处分无效。
  
• 证据充分性：处理决定需基于充分证据，否则可能面临行政复议或诉讼风险。
  
• 比例原则：处分应与行为性质、情节及后果相适应，避免过度处罚。

若您遇到具体问题，如单位处理程序违法或处分决定不当，可进一步向我咨询，我将结合案情提供详细法律意见。