工厂扣押身份证是违法的。以下从法律背景、法律建议和可能的法律后果三个角度进行详细分析：

一、法律背景

根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条的规定：“用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。”这一规定明确禁止了用人单位扣押劳动者身份证的行为，旨在保护劳动者的合法权益，防止用人单位以任何形式侵犯劳动者的自由和权利。

同时，《中华人民共和国居民身份证法》第十五条也明确规定：“任何组织或者个人不得扣押居民身份证，但是公安机关依照《中华人民共和国刑事诉讼法》执行监视居住强制措施的情形除外。”工厂作为一般的组织单位，并不具备扣押居民身份证的法定权限。

二、法律建议

如果工厂擅自扣押了劳动者的身份证，劳动者有权要求工厂立即返还。若工厂拒不归还，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 向劳动监察部门投诉：劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉工厂的违法行为。劳动监察部门将依法对工厂进行调查，并责令其限期退还劳动者的身份证。同时，工厂还可能面临相应的处罚。
2. 直接报警：劳动者也可以选择直接报警，由公安机关依法处理工厂的违法行为。公安机关将根据实际情况对工厂进行查处，并保障劳动者的合法权益。
3. 寻求法律援助：如果劳动者在维权过程中遇到困难或需要更专业的帮助，可以寻求法律援助机构的支持，以获取法律上的咨询和指导。

三、可能的法律后果

1. 对于工厂：工厂扣押身份证的行为违反了劳动法律法规的强制性规定，属于违法行为。由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并可能面临罚款等行政处罚；若构成犯罪，还将依法追究刑事责任。
2. 对于劳动者：如果因身份证被扣押而遭受损失，劳动者有权要求工厂承担相应的赔偿责任。例如，因身份证被扣押而无法及时办理银行业务、出行受阻等造成的直接经济损失，都可以向工厂提出赔偿要求。

总结来看，工厂扣押员工身份证是违法的，劳动者应了解自己的权利，并在遭遇此类情况时及时采取措施保护自己的合法权益。通过向劳动监察部门投诉、直接报警或寻求法律援助等方式，劳动者可以有效地维护自己的身份证件安全和个人权益。如果还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。