针对您提出的“要转让工厂股权，但工会不同意怎么办”的问题，这确实是一个涉及公司法、劳动法以及公司内部治理结构的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、理解工会角色与权益
首先，需要明确的是，工会作为代表员工利益的组织，在公司重大决策中，尤其是涉及员工切身利益的事项上，拥有一定的发言权和参与权。股权转让可能影响到公司的经营方向、员工福利、工作稳定性等多个方面，因此工会的反对并非无理取闹，而是基于对员工利益的考量。
二、分析工会反对的原因
- 员工利益受损担忧：工会可能担心股权转让后，新股东的经营策略会损害员工利益，如降低薪资、削减福利、裁员等。
- 信息不对称：工会可能认为转让方未充分披露转让信息，导致员工对转让后果缺乏了解。
- 程序合规性：工会可能质疑股权转让的程序是否合法合规，如是否经过必要的股东会决议、是否履行了信息披露义务等。
三、应对策略
加强沟通与协商：
- 主动沟通：转让方应主动与工会进行沟通，解释股权转让的背景、目的、预期效果等，消除工会的疑虑。
- 协商解决方案：针对工会的担忧，提出具体的解决方案，如保证员工薪资福利不变、提供员工安置方案等。
审查公司章程与法律法规：
- 公司章程：查看公司章程中关于股权转让的规定，确保转让行为符合章程要求。
- 法律法规：确保股权转让行为符合《公司法》、《劳动法》等相关法律法规的规定，避免因违法而导致的转让无效。
考虑优先购买权：
- 如果工会或员工代表愿意行使优先购买权，转让方应按照同等条件（如价格、付款方式等）与工会或员工代表进行协商。
寻求第三方调解或仲裁：
- 如果双方协商无果，可以考虑寻求第三方调解或仲裁机构的帮助，以公正、客观的方式解决争议。
准备司法途径：
- 在极端情况下，如果工会持续反对且无法通过协商解决，转让方可能需要考虑通过诉讼等司法途径来确认股权转让的合法性与有效性。但这一步骤应谨慎使用，因为诉讼可能耗时耗力，且结果具有不确定性。
四、预防措施
为了避免未来类似情况的发生，转让方在股权转让前应做好以下工作：
- 充分披露信息：确保所有股东和员工对股权转让有充分的了解。
- 提前沟通：在正式转让前，与工会和员工代表进行充分的沟通，听取他们的意见和建议。
- 制定详细方案：制定包括员工安置、薪资福利保障等在内的详细转让方案，以消除工会的担忧。
综上所述，面对工会不同意股权转让的情况，转让方应保持冷静、理性，通过加强沟通与协商、审查公司章程与法律法规、考虑优先购买权、寻求第三方调解或仲裁以及准备司法途径等多种方式来解决问题。同时，也应从预防角度出发，做好充分的信息披露和沟通工作。