当预缴合同金额超过外管证（这里假设外管证指的是与合同相关的某种官方许可或备案文件，其中明确了合同金额）上所载明的合同金额时，您可以按照以下步骤来处理：
一、明确超出原因
首先，需要弄清楚超出合同金额的具体原因。这可能是由于：
- 合理的价格波动：例如，原材料价格上涨导致成本增加，或者市场供需关系变化影响了价格。
- 合同履行中的必要变更：在合同执行过程中，可能因为一些不可预见或必要的因素（如工程中增加了合理的项目、服务范围扩大等）导致金额增加。
- 擅自超金额：一方未经对方同意，单方面提高了合同金额，这通常构成违约。
二、根据原因采取相应措施
1. 合理价格波动或合同变更
- 协商签订补充协议：如果超出金额是由于合理的价格波动或合同履行中的必要变更，双方应坐下来协商，并签订补充协议。在协议中明确超出部分的金额、支付方式、履行期限等关键条款，以确保合同的顺利执行。
2. 擅自超金额
- 要求违约方承担责任：如果有一方未经对方同意就擅自超出合同金额，这属于违约行为。受损的一方可以要求违约方：
- 继续履行合同，使合同金额回到约定的范围。
- 采取补救措施，尽量减少损失。
- 赔偿因为违约给自己带来的损失。
- 协商解决争议：双方对超出的金额有争议时，应首先尝试协商解决。
- 依据合同约定解决争议：如果协商不成功，应按照合同中约定的争议解决办法来处理。这通常包括仲裁或向法院提起诉讼。由仲裁机构或法院根据实际情况和法律规定做出裁决。
三、具体操作建议
- 收集证据：在处理超出合同金额的问题时，务必收集并保存好所有相关证据，如合同文本、补充协议、沟通记录、支付凭证等。
- 及时沟通：一旦发现预缴金额超过外管证上的合同金额，应立即与对方沟通，明确原因并寻求解决方案。
- 遵循法律程序：如果无法通过协商解决争议，应遵循合同约定的法律程序，如仲裁或诉讼，以维护自己的合法权益。
四、示例说明
假设您与某供应商签订了一份采购合同，合同金额为100万元，并已在外管证上备案。在履行过程中，供应商要求您支付120万元，称是因原材料价格上涨导致成本增加。但您认为合同已明确金额，供应商未经您同意擅自提高金额构成违约。此时，您可以：
- 与供应商协商，要求其提供成本增加的详细证据，并讨论是否可以通过签订补充协议来解决。
- 如果协商无果，您可以依据合同中的争议解决条款，通过仲裁或向法院提起诉讼来维护自己的权益。
总之，当预缴合同金额超过外管证上的合同金额时，关键是要明确原因、协商解决，并在必要时遵循法律程序来维护自己的合法权益。