已经立案后发现犯罪嫌疑人是精神病，处理方式主要依据其犯罪时的精神状态及刑事责任能力来确定。具体来说，可以从以下几个方面进行分析和处理：

一、精神病鉴定与刑事责任能力

1. 精神病鉴定程序：

   • 立案后，如果怀疑犯罪嫌疑人有精神病，应当进行精神病司法鉴定。
   • 鉴定程序包括：中心在受理后的15个工作日内完成鉴定工作，并出具完整、规范的鉴定报告；鉴定前，鉴定人应预先阅卷，了解案情，作必要的核实；精神病司法鉴定工作由办公室主任或中心指定的人员主持，参加司法鉴定的人员不少于三人（其中鉴定人不少于二人）；鉴定结论后，参加鉴定的精神病司法鉴定人应当签署鉴定意见，如有不同意见时应记录在案；鉴定结论以《鉴定书证审查意见书》的形式作出，经鉴定人签字并加盖本中心公章后生效。

2. 刑事责任能力判定：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第十八条，精神病人在不能辨认或者不能控制自己行为的时候造成危害结果，经法定程序鉴定确认的，不负刑事责任。
   • 间歇性的精神病人在精神正常的时候犯罪，应当负刑事责任。
   • 尚未完全丧失辨认或者控制自己行为能力的精神病人犯罪的，应当负刑事责任，但是可以从轻或者减轻处罚。

二、处理措施

1. 不追究刑事责任的情况：

   • 如果经鉴定确认，犯罪嫌疑人在犯罪时确实不能辨认或者不能控制自己的行为，那么根据法律规定，不追究其刑事责任。
   • 此时，应当责令其家属或者监护人严加看管和医疗；在必要的时候，由政府强制医疗。

2. 追究刑事责任的情况：

   • 如果犯罪嫌疑人在犯罪时精神正常，或者虽然患有精神病但尚未完全丧失辨认或者控制自己行为的能力，那么应当追究其刑事责任。
   • 在这种情况下，可以根据其精神状况，从轻或者减轻处罚。

三、后续程序

1. 撤销案件或不起诉：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，如果经鉴定确认犯罪嫌疑人不负刑事责任，那么已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪。

2. 强制医疗程序：

   • 对于不负刑事责任的精神病人，如果其有继续危害社会的可能，可以由政府强制医疗。

在实际操作中，如果遇到已经立案后发现犯罪嫌疑人是精神病的情况，建议及时联系专业律师或相关机构进行精神病鉴定，并根据鉴定结果采取相应的法律措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。