若没有直接证据证明对方不同意修改协议，并不意味着无法维护自身权益，可以从以下几个角度来分析和应对：

1. 寻找间接证据：

   • 沟通记录：尽管没有直接的书面或录音证据表明对方不同意修改，但可以回顾双方之前的沟通记录，如邮件、短信、微信聊天记录等，看是否有对方对修改协议持保留态度或明确反对的表述。这些间接证据有时也能起到一定的证明作用。
   • 行为表现：观察对方在协议修改后的行为表现，如是否继续按照原协议履行义务，或者是否有其他行为表明其不认可修改后的协议。这些行为表现也可以作为间接证据。

2. 利用法律原则进行推断：

   • 诚实信用原则：在合同法中，诚实信用原则是一项基本原则。如果对方在协议修改过程中存在不诚实、不守信用的行为，如故意隐瞒真实意图、误导对方等，可以据此推断对方可能不同意修改协议，并据此主张自己的权益。
   • 合同履行情况：如果对方在协议修改后未按照修改后的内容履行义务，而是继续按照原协议履行，这也可以作为推断对方不同意修改协议的一个依据。

3. 考虑其他证明方式：

   • 证人证言：如果有第三方见证了双方关于协议修改的讨论或协商过程，并且该第三方愿意出庭作证，那么证人证言也可以作为一种证明方式。
   • 专家意见：在某些情况下，可以聘请相关领域的专家对协议修改的必要性和合理性进行评估，并出具专家意见。虽然专家意见不能直接证明对方不同意修改协议，但可以为法院或仲裁机构提供参考。

4. 法律救济途径：

   • 协商与调解：首先可以尝试与对方进行协商或调解，看是否能够达成一致意见。在协商或调解过程中，可以注意收集和固定相关证据，以备后续使用。
   • 诉讼或仲裁：如果协商或调解无果，可以考虑通过诉讼或仲裁的方式来解决争议。在诉讼或仲裁过程中，需要充分准备和提交相关证据，以支持自己的主张。

5. 预防措施：

   • 完善协议条款：在未来的协议签订中，可以更加完善协议条款，明确双方的权利和义务，以及协议修改的程序和条件。这样可以减少因协议修改而产生的争议。
   • 保留证据：在协议修改过程中，注意保留相关证据，如修改建议、讨论记录、对方反馈等。这些证据在未来的争议解决中可能起到关键作用。

在处理此类问题时，建议保持冷静和理性，不要因情绪激动而做出过激行为。同时，也要及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。