针对您提出的“工伤认定后第三方赔偿问题怎么办”的疑问，以下是我为您提供的详细解答：
一、工伤认定与第三方赔偿的基本原则
工伤认定申请：首先，您需要向当地的劳动保障行政部门提出工伤认定申请。申请时，请务必准备好能证明劳动关系的劳动合同、能说明受伤情况的医疗诊断证明等相关材料。这是享受工伤保险待遇的前提。
第三方赔偿不影响工伤待遇：即使工伤是由第三方造成的，您依然有权享受工伤保险待遇。工伤保险基金或用人单位在支付相关费用后，有权向第三方进行追偿。
二、赔偿项目的处理原则
不重复赔偿原则：对于一些实际支出且用于填补损失的费用，如医疗费、误工费等，遵循不重复赔偿原则。这意味着，如果第三方已经进行了赔付，工伤保险基金或用人单位就无需再次支付。
专属工伤保险待遇：对于伤残津贴、一次性伤残补助金等专属工伤保险待遇项目，您可以正常从工伤保险基金或用人单位处获得相应赔偿。这些项目是工伤保险特有的，不受第三方赔偿的影响。
三、实践操作建议
先完成工伤认定：建议您先完成工伤认定和赔偿程序，确保自己能够享受工伤保险待遇。
再向第三方索赔：在完成工伤认定后，您可以同时向第三方提出民事赔偿要求。如果与第三方协商赔偿事宜没有达成一致，您可以通过民事诉讼途径解决。
保留相关证据：在处理过程中，请注意保留好相关证据，如事故责任认定书、医疗票据等。这些证据将有助于您维护自身合法权益。
四、具体案例分析
以小朱为例，他在上班途中遭遇交通事故受伤。虽然单位认为这不属于工伤，但小朱向劳动保障行政部门申请了工伤认定，并得知肇事司机应承担赔偿责任。在这种情况下，小朱可以同时主张工伤赔偿和向肇事司机索赔。对于医疗费用等已获第三方赔偿的实际支出费用，工伤保险基金不再重复支付；但对于一次性伤残补助金等专属工伤保险待遇项目，小朱可以兼得。
五、特殊情况处理
如果用人单位没有依法为您缴纳工伤保险费，您有权要求用人单位支付应有的工伤保险待遇。这是法律赋予您的权利，请务必了解并行使。
综上所述，工伤认定后第三方赔偿问题并不复杂。只要您了解相关原则、保留好相关证据，并依法行使自己的权利，就能够妥善处理这一问题。希望以上解答能够对您有所帮助。