当员工主动辞去领导层职务时，公司应按照以下步骤和原则进行处理：
一、离职手续办理
书面离职申请：
- 要求员工提交书面的离职申请，明确标注离职原因、离职日期等关键信息。这是处理离职事宜的基础，有助于公司了解员工的离职意图，并安排后续工作。
工作交接：
- 指派专门的人员与离职员工进行工作交接，确保公司业务的连续性和稳定性。交接内容应涵盖公司的财物、工作文档、客户资料等所有相关事项。
- 制作详细的交接清单，并由双方签字确认，以确保交接的准确性和完整性。
二、薪酬与福利处理
工资结算：
- 严格按照规定结算员工的工资至其离职日期，确保员工的劳动成果得到应有的回报。
未休年假处理：
- 如果员工有未休的年假，公司应依照相关法律法规支付相应的报酬，以保障员工的合法权益。
三、社会保险与公积金处理
- 减员手续：
- 在规定的时间内为离职员工办理社会保险和住房公积金的减员手续，这是公司的法定义务，也是保障员工权益的重要措施。
四、法律文件保存
- 离职文件保存：
- 妥善保存员工的离职相关文件，如离职申请、工作交接清单等。这些文件至少应保存两年时间，以备在可能出现的劳动争议等情况发生时，能够方便地进行查询和使用。
五、特殊情况处理
经济补偿：
- 通常情况下，员工主动辞去领导层职务并不享有经济补偿。但是，如果员工离职是因为公司存在违法行为（如未提供必要的工作保障、未及时足额支付劳动报酬等），员工则有权要求公司支付经济补偿金。
- 在这种情况下，公司应仔细核实员工的离职原因，并按照相关法律法规进行经济补偿。
解除劳动关系证明：
- 向离职员工开具正式的解除劳动关系证明文件，这是员工后续就业或享受相关权益的重要依据。
六、后续沟通与关系维护
保持沟通：
- 在员工离职后，公司可以保持与员工的适当沟通，了解员工的职业发展和生活状况，为未来的合作或推荐打下基础。
关系维护：
- 尽管员工已经离职，但公司仍应尊重员工的个人选择和职业发展，避免因处理不当而损害公司的声誉和形象。
总结来说，当员工主动辞去领导层职务时，公司应确保离职手续的合规性、薪酬与福利的准确性、社会保险与公积金的及时处理、法律文件的妥善保存，并在特殊情况下依法进行经济补偿。同时，公司还应保持与离职员工的适当沟通，维护良好的关系。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。