结论前置：员工因工作失误违反公司制度，但未签字同意就被公司扣除工资，这一行为是否合法需结合具体情况判断。若公司扣工资行为符合合法、合理且明确的规章制度，并遵循了相关法律法规，则可能是合法的；否则，不合法。
合法情形分析
有明确且合法的规章制度：
- 公司应制定合法有效的规章制度，明确规定何种工作失误会导致工资扣减，且这些规定不违反法律法规的强制性规定。规章制度需详细列明失误类型、扣减标准等，以便员工清晰了解并遵守。
- 关键点：规章制度必须合法、明确，且员工应知晓其内容。若员工未签字，但公司能证明规章制度已通过其他方式（如公示、培训等）告知员工，且员工实际知晓，则可能视为有效。
规章制度民主制定并公示：
- 根据《劳动合同法》规定，涉及劳动者切身利益的规章制度应经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
- 规章制度制定后，公司应将其公示或告知劳动者，确保员工知晓并理解相关规定。若员工未签字，但公司能提供证据证明规章制度已公示或以其他方式告知员工，则可能视为已履行告知义务。
失误与损失有直接关联，且扣减数额合理：
- 员工的工作失误必须确实给公司造成了经济损失，且公司能够证明这种直接因果关系。
- 扣减工资的数额应与员工失误所造成的损失相适应，且不得超过法律规定的上限（如每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准）。
不合法情形分析
缺乏制度依据或制度不合法：
- 若公司没有制定相关规章制度，或虽有制度但未明确规定工作失误的扣工资情形，却随意以工作失误为由扣减员工工资，则这一行为不合法。
- 若公司的规章制度违反法律法规的规定，如扣减工资的比例过高、对工作失误的界定不合理等，或规章制度的内容或制定程序不符合法律规定（如未经民主制定、未公示等），则扣工资行为也不合法。
无法证明损失与失误的关联，或扣减数额不合理：
- 若公司无法提供充分证据证明员工的工作失误与公司所声称的经济损失之间存在直接因果关系，或扣减工资的数额超过了法律规定的上限，则扣工资行为可能不合法。
员工未签字且公司无法证明已履行告知义务：
- 若员工未签字同意扣工资，且公司无法提供证据证明规章制度已公示或以其他方式告知员工，则扣工资行为可能因缺乏员工同意而无效。
员工权益保护建议
- 与公司协商解决：首先尝试与公司进行沟通，了解扣工资的具体原因和依据，并提出自己的异议和诉求。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：若投诉仍无法解决问题，员工可以依法向劳动仲裁委员会提起劳动仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
总结：员工因工作失误违反公司制度，但未签字同意就被公司扣除工资，这一行为是否合法需结合公司规章制度、民主制定程序、公示告知情况、失误与损失的关联性以及扣减数额的合理性等多方面因素进行综合判断。员工在面临此类问题时，应了解自己的权益和保护途径，必要时可寻求法律援助以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。