在仲裁期间公司注销，并不意味着您的维权之路就此终结，您仍可通过法律途径维护自身权益。具体处理方式需根据公司的注销程序及清算情况来定，以下从不同角度为您详细分析：
一、公司注销程序合规且清算完毕
仲裁程序受阻：若公司在仲裁期间依法完成注销手续，其主体资格消失，无法再作为仲裁的被申请人。此时，仲裁程序可能会因公司主体不存在而面临一定阻碍。
追究清算主体责任：尽管公司已注销，但清算主体（如股东、董事等）在公司注销前应妥善处理未了结的仲裁事宜。若清算主体未履行相关义务，如未代表公司参加仲裁活动、未履行仲裁裁决等，您作为劳动者或其他仲裁当事人，可向法院提起诉讼，要求清算主体承担相应的法律责任，包括继续履行仲裁裁决、赔偿损失等。
二、公司注销程序存在瑕疵或未清算
追究股东或清算责任人责任：若公司未经依法清算即办理注销登记，或清算过程中存在故意或重大过失，导致债权人（包括您作为劳动者）权益受损，您可依法追究股东或清算责任人的责任。具体来说，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人，可能需对公司债务承担清偿责任。
起诉股东协议：若您与公司股东之间存在股东协议，且该协议中约定了股东在公司注销过程中的责任，您可依据股东协议及相关法律规定，起诉股东承担相应责任。起诉时需准备好股东协议、公司注销相关文件等证据，以证明股东在公司注销过程中的行为及责任。
三、具体操作建议
收集证据：无论公司注销程序是否合规，您都应尽快收集与公司注销、仲裁相关的所有证据，包括仲裁文书、债权凭证、公司注销登记材料、清算报告等。这些证据将在后续的诉讼或仲裁程序中发挥关键作用。
咨询专业律师：虽然我作为郭佳宁律师已经为您提供了详细的法律分析，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，我建议您在采取任何法律行动前，先咨询专业律师，以确保您的权益得到最大程度的保护。不过，您现在就可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供针对性的法律建议。
及时采取法律措施：一旦发现公司注销可能影响您的仲裁权益，您应及时采取法律措施，如向法院提起诉讼、申请财产保全等。拖延时间可能会导致证据灭失或对方转移财产，从而增加您的维权难度。
最后需要强调的是，公司注销并不意味着责任随之消失。您作为劳动者或其他仲裁当事人，仍可通过法律途径追究相关责任主体的法律责任。在处理此类案件时，请务必保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。