若在劳动仲裁期间公司注销了，劳动者仍可通过法律途径维护自身权益，具体处理方式需根据公司注销程序的合法性来分情况讨论。

一、公司注销程序合法的情况

1. 查询注销文件：

   • 若公司注销程序合法，劳动者可向作出注销决定的登记机关查询公司注销的相关文件，如清算报告等，以了解公司注销的具体情况和清算过程。

2. 申报债权：

   • 根据相关法律规定，清算组应在成立之日起十日内通知债权人，并在六十天内在报纸上公告。劳动者作为债权人，应自接到通知书之日起三十日内申报债权，未接到通知书的则自公告之日起四十五日内申报。
   • 劳动者可以以债权人的身份去申报债权，要求在公司清算财产里优先获得劳动报酬等权益。若清算财产不够清偿全部债务，劳动者还能依照法律规定，参与公司剩余财产的分配或者按比例受偿。

3. 追加清算组成员为被申请人：

   • 若公司依法清算注销，劳动者在劳动仲裁中可追加清算组成员为被申请人，要求其承担相应责任。依据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释(一)》，劳动者可要求清算组成员承担因未依法履行清算义务而给劳动者造成的损失。

二、公司注销程序违法的情况

1. 起诉要求承担清偿责任：

   • 若公司未经依法清算即办理注销登记，劳动者可要求有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。
   • 劳动者可提供公司未依法清算的证据，通过仲裁或诉讼要求上述主体承担支付工资、经济补偿等义务。

2. 要求清算组成员承担赔偿责任：

   • 若清算组未按规定履行通知和公告义务，导致劳动者未及时申报债权而未获清偿，劳动者可要求清算组成员对因此造成的损失承担赔偿责任。

三、具体操作建议

1. 收集证据：

   • 劳动者应收集与公司注销相关的证据，如清算报告、公告、通知等，以及证明自身劳动权益受损的证据，如劳动合同、工资单、工作证等。

2. 咨询专业律师（此处为引导性说明，实际回答中不直接提及）：

   • 虽然我作为喻燕立律师可以直接为你提供法律咨询，但在实际操作中，若情况复杂或涉及金额较大，建议劳动者咨询专业律师以获取更具体的法律建议。不过，你现在就可以直接向我提问，我会根据你的具体情况给出详细的法律分析。

3. 向法院起诉：

   • 若协商不成或仲裁结果不满意，劳动者可向法院起诉维权，将相关责任主体列为被告，要求其承担相应责任。

四、注意事项

• 地区差异：具体的操作和法律适用可能在不同地区会有所差别，劳动者在处理时应结合当地的具体规定和司法实践。
• 时效限制：劳动者在维护自身权益时，应注意相关的时效限制，如仲裁时效、诉讼时效等，以免因超过时效而丧失胜诉权。

当面临劳动仲裁期间公司注销的情况时，劳动者不必过于担忧。通过合法途径和法律手段，仍可有效维护自身权益。如果你正在遭遇这样的困扰，或者对如何处理此类问题有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出详细的法律建议。