若扫描单位委托书接工程的行为已被认定为不合法，首先需明确的是，该行为可能涉及无权代理、超越代理权限或伪造委托文件等法律问题，并可能因此承担相应的法律责任。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律责任分析
无权代理或超越代理权限：
- 若扫描的单位委托书并非真实有效，或持有人无权代表该单位签订工程合同，则构成无权代理或超越代理权限。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权代理人以被代理人的名义订立的合同，未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力，由行为人承担责任。
- 在此情况下，若工程合同已被履行，且相对方（如发包方）不知情且无过失，则可能构成表见代理，但持有人仍需对因其无权代理行为给相对方造成的损失承担赔偿责任。
伪造委托文件：
- 若扫描的单位委托书系伪造，则持有人可能涉嫌伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪等刑事犯罪。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金。
- 此外，持有人还需对因其伪造行为给相关单位或个人造成的损失承担民事赔偿责任。
二、应对措施建议
立即停止违法行为：
- 若发现扫描单位委托书接工程的行为不合法，应立即停止相关行为，避免进一步扩大法律风险。
与相关方沟通协商：
- 主动与发包方、承包方等相关方进行沟通协商，说明情况，寻求解决方案。
- 若可能，可协商解除或变更工程合同，以减少损失。
寻求法律救济：
- 若因不合法行为已给相关方造成损失，应积极寻求法律救济，如通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。
- 在此过程中，应充分准备证据材料，以维护自身合法权益。
配合调查处理：
- 若相关行为已涉嫌违法犯罪，应积极配合司法机关的调查处理工作。
- 如实陈述事实，提供相关证据材料，以争取从轻或减轻处罚。
三、预防措施建议
加强内部管理：
- 单位应建立健全内部管理制度，加强对委托文件的审核和管理。
- 明确委托文件的签署、审核、保管等流程，确保委托文件的真实性和有效性。
提高法律意识：
- 加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和风险防范能力。
- 确保员工在签订工程合同等法律文件时，能够严格遵守法律法规和单位规章制度。
建立风险预警机制：
- 单位应建立风险预警机制，及时发现和应对可能存在的法律风险。
- 定期对工程合同等法律文件进行审查和评估，确保合同的合法性和有效性。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。