针对您提出的“致1人轻伤的生产安全事故怎么处理”的问题，以下是我根据相关法律法规及实际案例为您提供的详细解答：
一、事故报告与调查
事故报告：
- 根据《中华人民共和国安全生产法》及《生产安全事故报告和调查处理条例》，发生生产安全事故后，事故现场有关人员应当立即报告本单位负责人。
- 单位负责人接到事故报告后，应当迅速采取有效措施，组织抢救，防止事故扩大，减少人员伤亡和财产损失，并按照国家有关规定立即如实报告当地负有安全生产监督管理职责的部门。
- 在您提到的案例中，山东聚农生物科技有限公司未按照相关规定报告事故，这是不合法的，并可能面临相应的法律责任。
事故调查：
- 负有安全生产监督管理职责的部门接到事故报告后，应当立即启动事故调查程序。
- 事故调查组由有关人民政府、安全生产监督管理部门、负有安全生产监督管理职责的有关部门、监察机关、公安机关以及工会派人组成，并应当邀请人民检察院派人参加。
- 事故调查组应按照科学严谨、依法依规、实事求是、注重实效的原则，查清事故发生的原因、经过、人员伤亡和直接经济损失，认定事故的性质和责任。
二、事故处理与责任追究
行政处罚：
- 对于发生生产安全事故的生产经营单位，应急管理部门可以根据事故的严重程度和影响范围，依法给予行政处罚，包括罚款、责令停产停业整顿、吊销许可证等。
- 在您提到的案例中，虽然事故造成一人轻伤，达不到一般生产安全事故等级，但企业仍可能因安全生产主体责任落实不到位、现场作业安全管理不到位等问题受到行政处罚的警示或建议整改。
刑事责任：
- 如果事故涉及重大责任事故罪或其他犯罪行为，相关责任人员可能面临刑事责任的追究。
- 在您提到的案例中，若企业主要负责人存在瞒报事故等违法行为，可能依据《中华人民共和国安全生产法》的相关规定受到罚款等行政处罚，情节严重的还可能涉及刑事责任。
民事赔偿：
- 生产经营单位发生生产安全事故造成人员伤亡、他人财产损失的，应当依法承担赔偿责任。
- 拒不承担或者其负责人逃匿的，由人民法院依法强制执行。
三、事故防范与整改措施
加强安全生产教育和培训：
- 生产经营单位应加大安全生产教育和培训力度，保证员工具备必要的安全生产知识，掌握本岗位的安全操作技能。
完善安全生产规章制度：
- 生产经营单位应制定完善的安全生产规章制度及操作规程，明确各岗位的安全职责和操作要求。
建立事故应急处置机制：
- 生产经营单位应建立生产安全事故应急处置规范制度流程，确保事故发生后能够得到有序处置。
加强监管与检查：
- 属地政府和行业主管部门应加强对生产经营单位的监管与检查，督促企业严格落实安全生产主体责任。
四、实际案例参考
以山东聚农生物科技有限公司“3·3”车辆伤害事故为例，该事故造成1人轻伤，直接经济损失约14万元。事故调查组认定该起事故系一起生产安全责任事故，并涉及瞒报。最终，企业主要负责人因履行安全生产管理职责不到位、瞒报事故等违法行为受到了相应的行政处罚。
综上所述，对于致1人轻伤的生产安全事故，应依法进行事故报告与调查、处理与责任追究，并采取有效的事故防范与整改措施，以杜绝类似事故的再次发生。希望以上解答能对您有所帮助。