当肇事司机不配合理赔时，保险公司是否会进行赔偿，这确实是一个涉及多方面因素的问题。以下是我为您详细梳理的解答：

首先，我们要明确的是，若事故符合保险合同约定的理赔条件，即便肇事司机不配合，保险公司也应在责任范围内进行赔偿。以交强险为例，如果被保险人（即肇事司机）在交通事故中导致他人伤亡或财产损失，保险公司是有义务在责任限额内进行赔偿的。这是保险合同的基本义务，也是保险公司对被保险人及第三方受害者的基本保障。

然而，在实际操作中，可能会遇到肇事司机故意不配合，导致理赔材料无法提供的情况。这时，被保险人或受害者可以通过法律途径，要求保险公司先予赔偿，再由保险公司向肇事司机追偿。这是因为，保险公司的赔偿义务是基于保险合同和法律规定，而肇事司机的不配合行为并不能免除保险公司的赔偿责任。保险公司赔偿后，有权向造成事故的肇事司机进行追偿。

另外，我们还需要注意一种特殊情况，即如果肇事司机的行为违反了保险合同约定，且这种行为影响到了保险事故的性质、原因、损失程度等的确定，那么保险公司可能对无法确定的部分不承担赔偿责任。例如，如果肇事司机故意隐瞒事故真相，或者拒绝提供必要的理赔材料，导致保险公司无法准确判断事故责任和损失程度，那么保险公司可能会对这部分无法确定的损失拒绝赔偿。

在实际案例中，比如小何驾车与小李的车辆发生碰撞，造成小李车辆受损。经认定小何为肇事方，应承担赔偿责任。但小何故意不配合理赔，不提供相关材料。这时，小李可以要求保险公司赔偿。如果保险公司以小何不配合、无法确定损失程度为由拒绝部分赔偿，双方可能会产生争议。在这种情况下，小李可以通过法律途径来维护自己的权益，比如申请“代位求偿”，由保险公司先予赔偿，再由保险公司向小何追偿；或者直接向法院起诉小何和保险公司，要求承担赔偿责任。

综上所述，当肇事司机不配合理赔时，保险公司是否会赔偿取决于多个因素，包括保险合同约定、肇事司机的行为以及法律途径的选择等。因此，在遇到这种情况时，建议您及时咨询专业律师或保险公司的客服人员，以便更好地维护自己的权益。