没收5万元以上保证金的决定，通常由作出取保候审决定的机关，经设区的市一级以上公安机关负责人批准后作出。以下是对此问题的详细分析：

一、决定机关

没收保证金的决定通常由作出取保候审决定的机关来作出。这些机关主要包括：

1. 公安机关：负责侦查的案件，由县级以上公安机关决定没收保证金，但决定没收五万元以上保证金的，应当经设区的市一级以上公安机关负责人批准。
2. 国家安全机关：在涉及国家安全的案件中，若作出取保候审决定，同样有权决定没收保证金。
3. 人民检察院：对于检察机关负责侦查的案件，由作出决定的人民检察院来决定没收保证金。
4. 人民法院：在审判阶段，若需要没收保证金，由人民法院作出决定。

二、决定程序

1. 审核与批准：需要没收保证金的，应当经过严格审核后，报县级以上公安机关负责人批准（没收五万元以上保证金的，需经设区的市一级以上公安机关负责人批准）。
2. 制作决定书：批准后，制作没收保证金决定书。
3. 宣读与签名：公安机关应当在三日以内向被取保候审人宣读没收保证金决定书，并责令其在决定书上签名、捺指印。若被取保候审人在逃或者具有其他情形不能到场的，应当向其成年家属、法定代理人、辩护人或者单位、居住地的居民委员会、村民委员会宣布，并由相关人员在没收保证金决定书上签名。

三、法律依据

• 根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第九十七条：需要没收保证金的，应当经过严格审核后，报县级以上公安机关负责人批准，制作没收保证金决定书。决定没收五万元以上保证金的，应当经设区的市一级以上公安机关负责人批准。
• 第九十八条第一款：没收保证金的决定，公安机关应当在三日以内向被取保候审人宣读，并责令其在没收保证金决定书上签名、捺指印。

四、实际案例与操作

在实际操作中，如果被取保候审人违反了取保候审的规定，如未经批准擅自离开所居住的市、县，或者住址、工作单位和联系方式发生变动却未在二十四小时内告知执行机关等，执行机关就有权责令其具结悔过，重新交纳保证金或者提出保证人，亦或是采取监视居住、予以逮捕等措施。若情节较为严重，执行机关则有权没收部分甚至全部保证金。

建议：

• 若您或他人面临保证金被没收的情况，建议及时咨询专业律师，了解具体程序和权利保障。
• 在取保候审期间，务必严格遵守相关规定，避免违规行为导致保证金被没收。

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