核心结论：在刑事案件中，若保证金一万被没收五千后，您可采取以下措施：1. 了解没收原因；2. 申请复议或申诉；3. 考虑法律救济途径。以下是对各点的详细说明：

1. 了解没收原因

   • 首先，您需要明确保证金被没收的具体原因。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，保证金被没收通常是因为被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人违反了取保候审的规定，如未经批准离开居住地、传讯时不到案等。
   • 您应联系作出没收决定的机关（通常是公安机关或检察机关），要求他们出具没收保证金的书面决定，并详细说明没收的原因和依据。

2. 申请复议或申诉

   • 如果您认为没收保证金的决定有误或不合理，您有权申请复议或申诉。
   • 复议：通常向作出没收决定的机关的上一级机关提出，要求重新审查没收决定。
   • 申诉：如果复议结果仍不满意，您可以向人民法院提出申诉，要求法院对没收决定进行司法审查。
   • 在申请复议或申诉时，您需要提供充分的证据和理由，证明您没有违反取保候审的规定，或者没收决定存在错误。

3. 考虑法律救济途径

   • 如果复议或申诉未能成功，您还可以考虑通过其他法律途径来维护自己的权益。
   • 例如，如果没收保证金的行为给您造成了经济损失，您可以考虑提起民事诉讼，要求赔偿。但这种情况较为特殊，通常需要证明没收行为存在违法或过错，并且与您的经济损失之间存在因果关系。
   • 另外，如果您认为没收保证金的行为涉及违法违纪，您还可以向相关部门（如纪检监察机关）进行举报。

额外建议：

• 在处理此类问题时，建议您保持冷静，不要采取过激行为。
• 及时咨询并寻求专业律师的帮助，律师可以根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。
• 保留好所有与案件相关的文件和证据，以便在需要时提供证明。