结论：店铺转让时收取三千元转租费用是否合理及合法，需结合合同约定、法律规定及实际情况综合判断。以下分情况说明：

1. 合同有明确约定时

若原合同中已明确约定转租需支付费用（如“转租费三千元”），且该条款不违反法律强制性规定（如未显失公平、未损害第三方利益），则转租方有权要求承租方支付该费用。
法律依据：

• 《民法典》第五百零九条：当事人应按约定全面履行义务。
  
• 若合同条款存在“格式条款”问题（如未提示对方注意），可能被认定无效，但需具体分析。

2. 合同无约定，但转租方实际投入成本

若合同未约定转租费，但转租方为店铺装修、设备购置等投入了成本，可主张“实际损失补偿”或“合理费用分摊”。此时需提供证据（如装修合同、付款凭证等），且费用应与转租直接相关。
法律依据：

• 《民法典》第五百八十四条：违约方应赔偿对方实际损失。
  
• 若转租行为未获原出租人同意，可能涉及违约责任，需谨慎处理。

3. 合同无约定，且无实际成本投入

若合同未约定转租费，且转租方未产生额外成本，强行收取三千元可能缺乏法律依据。此时承租方有权拒绝支付，或要求转租方说明费用合理性。
风险提示：

• 若转租方以“行业惯例”为由收费，需注意惯例不得违反法律（如不得构成“乱收费”）。
  
• 承租方可要求转租方出具费用明细，或协商调整金额。

4. 转租行为本身的合法性

无论是否收费，转租需满足以下条件：

• 原合同允许转租：若原租赁合同禁止转租，转租行为可能无效，甚至需承担违约责任。
  
• 原出租人同意：即使合同未禁止，转租前也应取得原出租人书面同意，否则可能面临解除合同风险。
  

建议行动：

1. 核查原租赁合同中关于转租的条款；
   
2. 与转租方协商费用明细及支付方式；
   
3. 必要时要求转租方提供费用依据（如发票、合同）；
   
4. 若争议无法解决，可依法通过诉讼或仲裁解决。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体细节。