针对您提出的“公交车司机内部违规怎么处理”的问题，这通常取决于违规的具体性质和严重程度。以下是一些一般性的处理流程和原则，供您参考：

一、违规行为的认定与分类

首先，需要对公交车司机的违规行为进行准确认定和分类。违规行为可能包括但不限于：服务态度差、违规操作、违反交通规则、擅离职守、与乘客发生冲突等。根据违规行为的性质和严重程度，可以将其分为轻微违规、一般违规和严重违规。

二、内部处理流程

1. 投诉与受理：

   • 乘客或其他相关人员可以通过公交公司的客服热线、投诉邮箱或现场投诉等方式，向公交公司反映司机的违规行为。
   • 公交公司接到投诉后，应立即进行登记，并安排专人负责处理。

2. 调查与核实：

   • 公交公司应安排工作人员对投诉内容进行调查，包括与司机、乘客或其他目击者进行沟通，收集相关证据（如行车记录仪视频、乘客证言等）。
   • 根据调查结果，对违规行为进行核实，并确定违规的性质和严重程度。

3. 处理与处罚：

   • 对于轻微违规，公交公司可以对司机进行口头警告或书面警告，并要求其立即改正。
   • 对于一般违规，公交公司可以根据公司规定对司机进行罚款、扣分、停职培训等处罚。
   • 对于严重违规，如涉及违法犯罪行为（如以危险方法危害公共安全罪），公交公司应立即报警，并配合公安机关进行调查和处理。同时，公交公司可以根据公司规定对司机进行解雇等严厉处罚。

4. 反馈与回访：

   • 公交公司应将处理结果及时反馈给投诉人，并听取其意见和建议。
   • 对于处理结果不满意的投诉人，公交公司应进一步进行沟通和解释，直至投诉人满意为止。
   • 公交公司还可以对处理后的司机进行回访，了解其改正情况和思想动态，确保其今后能够遵守公司规定和交通规则。

三、外部监管与协作

• 公交公司应接受交通运输局等政府部门的监管和指导，确保处理流程的合规性和公正性。
• 对于涉及违法犯罪行为的司机，公交公司应积极配合公安机关进行调查和处理，共同维护公共交通安全秩序。

四、案例参考

以您提供的第二个参考信息为例，当乘客通过政务服务便民热线反映公交车司机服务态度差的问题时，交通运输局接诉后立即安排工作人员进行核查，并对驾驶员进行了批评教育，同时要求其进行培训学习，提高自身素质和服务意识。这一处理流程体现了对违规行为的及时响应和有效处理。

综上所述，公交车司机内部违规的处理需要根据违规行为的性质和严重程度进行准确认定和分类，并按照内部处理流程进行调查、处理、反馈和回访。同时，公交公司应接受政府部门的监管和指导，共同维护公共交通安全秩序。