企业不配合执法检查，执法机关有权采取多种措施进行处理，包括但不限于警告、罚款、行政拘留等，甚至可能构成犯罪。具体分析如下：
一. 行政处罚
警告与罚款：根据具体的执法领域和法律法规，对于不配合执法检查的企业，执法机关首先可能会给予警告，并可以处以一定数额的罚款。例如，在统计执法中，《中华人民共和国统计法》第四十一条规定，企业事业单位拒绝、阻碍统计调查、统计检查的，可以并处五万元以下的罚款；情节严重的，并处五万元以上二十万元以下的罚款。
其他行政处罚：除了警告和罚款，执法机关还可能采取暂扣或吊销许可证、执照等其他行政处罚措施。这取决于具体的执法领域和法律法规的规定。
二. 行政拘留
对于不配合执法且情节恶劣的行为，如辱骂、拉扯执法人员，严重扰乱执法秩序等，公安机关有权对当事人进行行政拘留，即短期限制其人身自由。
三. 刑事处罚
妨害公务罪：如果企业以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务，根据《中华人民共和国刑法》第二百七十七条的规定，将构成妨害公务罪，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。
其他相关罪名：根据具体的执法领域和情况，不配合执法检查还可能触犯其他罪名，如袭警罪等。
我建议，企业在面对执法检查时，应积极配合，遵守法律法规，避免不必要的法律后果。如遇具体法律问题或疑虑，可以及时咨询我，以获取准确的法律意见和帮助。