核心结论：入围两家中标价格不一样时，签订合同需根据招标文件要求、中标通知书内容及双方协商情况，选择合适的合同签订方式，确保合同条款合法、合规且明确双方权利义务。以下是具体分析：

1. 依据招标文件和中标通知书签订

• 招标文件优先：首先需审查招标文件是否对中标价格有明确规定（如“以最低价中标”或“综合评分最高者中标”）。若招标文件已明确中标价格确定规则，则合同价格应直接采用中标价格，不得擅自变更。
• 中标通知书效力：中标通知书是招标人向中标人发出的正式通知，具有法律效力。合同价格应与中标通知书载明的价格一致。若两家入围单位的中标价格不同，需确认哪一方的中标通知书已被正式发出，并以此为准签订合同。

2. 协商调整价格的合法性

• 允许调整的情形：若招标文件或中标通知书中未明确禁止价格调整，且双方协商一致，可在合同中约定价格调整机制（如因市场波动、设计变更等合理原因调整）。但需注意：
  • 调整需有书面依据（如补充协议）；
  • 不得违反《招标投标法》中“不得实质性修改招标文件和中标结果”的规定；
  • 避免以“低价中标、高价签约”的方式损害其他投标人利益。
• 禁止调整的情形：若招标文件明确“中标价格不得变更”，或调整价格缺乏合理依据，则不得擅自修改合同价格，否则可能面临行政处罚或合同无效风险。

3. 合同条款的明确性

• 价格条款：合同中应明确约定价格（含税/不含税）、支付方式、调整条件等，避免模糊表述。
• 违约责任：若一方擅自变更价格，应约定违约责任（如赔偿损失、解除合同等），以保障双方权益。
• 争议解决：建议约定争议解决方式（如仲裁或诉讼），并明确管辖地，降低后续纠纷成本。

4. 特殊情形处理

• 两家入围单位均中标：若招标文件允许分标段或部分中标，需明确各标段对应的价格及范围，并在合同中分项列明。
• 废标后重新招标：若原招标因价格问题废标，需重新发布招标公告，并严格按照法定程序重新评标、定标，不得直接以原入围单位价格签订合同。

建议：签订合同前，务必核对招标文件、中标通知书及双方协商记录，确保合同价格合法、合规。若对价格调整存在疑虑，可进一步提供具体招标文件内容或中标情况，以便更精准地分析。