合同金额与中标金额不一致时，原则上应以合同约定金额为准执行，但需结合具体情形判断合同效力及执行方式。具体分析如下：

1. 若合同金额系双方真实意思表示且无违法情形
   根据《民法典》第490条，合同自成立时生效（法律另有规定或当事人另有约定除外）。若双方在招投标程序后，通过补充协议、签证单等形式对中标金额进行合法调整（如因设计变更、工程量增减等客观原因），且调整后的金额未违反《招标投标法》第46条关于”不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议”的强制性规定，则应以合同约定金额执行。
   关键点：需留存变更依据（如会议纪要、设计变更通知、双方确认的工程量清单等），避免被认定为”黑白合同”。

2. 若合同金额与中标金额差异系因恶意串通、损害国家利益
   根据《民法典》第154条，若存在招标人与投标人串通压低/抬高合同金额，或通过”阴阳合同”规避税收、行贿等违法行为，则合同可能被认定无效。此时应按《民法典》第157条处理：

   • 返还财产或折价补偿；
     
   • 有过错方赔偿损失；
     
   • 违法所得可能被收缴。
     典型情形：中标价1000万，但另行签订800万合同并实际履行，且无合法变更理由。

3. 若因程序瑕疵导致金额不一致

   • 未履行法定变更程序：根据《招标投标法实施条例》第57条，合同金额变更需经原审批部门核准（如政府投资项目），否则可能面临行政处罚，但不影响合同民事效力；
     
   • 未在规定时限内提出异议：根据《招标投标法》第55条，若投标人发现中标金额错误但未在中标通知书发出后30日内提出异议，可能丧失主张权利的机会。

执行建议：

1. 立即核查合同变更的合法性依据（如变更审批文件、双方书面确认记录）；
   
2. 若存在违法情形，及时向行政监督部门举报（如住建部门、公共资源交易中心）；
   
3. 通过诉讼/仲裁主张权利时，需提供完整证据链（包括招投标文件、中标通知书、合同文本、变更记录等）；
   
4. 涉及政府投资项目时，注意《审计法》第23条关于审计结果作为结算依据的特殊规定。

风险提示：

• 合同金额与中标金额不一致可能引发”虚假招标”质疑，导致中标结果被撤销（《招标投标法》第64条）；
  
• 若差异金额超过中标价5%以上，可能被认定为”实质性内容变更”，面临行政处罚（《招标投标法实施条例》第75条）。
  

如有具体案情或证据材料，可进一步提供细节以便针对性分析。