当企业注册地与经营地不一致时，劳动者依然可以依法申请劳动仲裁，以下是具体分析和建议：

一、明确管辖仲裁委

1. 劳动合同履行地：即劳动者实际工作的场所。这是劳动者日常提供劳动的地方，相关证据材料（如考勤记录、工作证等）容易获取，选择在此申请仲裁对劳动者更为便利。
2. 用人单位所在地：一般指用人单位的注册、登记地。若用人单位未经注册登记，则其出资人、开办单位或主管部门所在地为用人单位所在地。在某些情况下，如果用人单位在注册地有更完善的档案记录等可能对劳动者有利的证据，劳动者也可以考虑向用人单位注册地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
3. 双方分别申请的处理：如果劳动者和用人单位分别向劳动合同履行地和用人单位所在地的仲裁委申请仲裁，根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，由劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会管辖。

二、准备仲裁材料

无论选择向哪个仲裁委申请仲裁，都需要准备以下材料：

1. 仲裁申请书：需载明劳动者与用人单位的基本信息、仲裁请求及事实理由等。
2. 证据材料：如劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等能证明劳动关系及相关事实的材料。
3. 申请人身份证明：如身份证复印件等。

三、提交申请及参加庭审

1. 提交申请：将准备好的材料提交给选定的劳动争议仲裁委员会。仲裁委员会将在收到仲裁申请之日起五日内决定是否受理。
2. 参加庭审：如果仲裁委员会受理申请，会安排开庭时间。双方当事人需按照通知准时参加庭审，进行举证、质证、辩论等环节。在庭审中，劳动者应积极陈述自己的诉求和事实，提供充分的证据支持自己的主张。
3. 等待裁决：庭审结束后，仲裁委员会将依据双方提供的证据和陈述作出裁决。一般情况下，仲裁庭会在受理仲裁申请之日起四十五日内作出裁决；案情复杂需要延期的，经劳动争议仲裁委员会主任批准，可以延期并书面通知当事人，但延长期限不得超过十五日。

四、后续行动

如果劳动者对仲裁结果不满意，还可以依法向人民法院提起诉讼。但在提起诉讼前，一般需要先经过仲裁程序。因此，劳动者应充分重视仲裁程序，积极准备和参与庭审，以维护自己的合法权益。

举例说明：假设小李在A市的一家公司工作，但该公司注册地在B市。小李与公司发生劳动争议后，认为在A市（工作地点）申请劳动仲裁更方便自己提供证据和参加仲裁活动。于是，小李准备了仲裁申请书、双方主体资料以及证据材料（如劳动合同、工资流水、考勤记录等），向A市的劳动争议仲裁委员会提出了仲裁申请。如果公司也向B市的劳动争议仲裁委员会提出了仲裁申请，根据法律规定，应由A市的劳动争议仲裁委员会管辖。

总之，当企业注册地与经营地不一致时，劳动者应根据自己的实际情况和需要，合理选择仲裁地点，并按照规定的流程准备材料、提交申请、参加庭审并等待裁决。在整个过程中，劳动者应充分保留并利用好相关证据材料，以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。