有毒有害工种停薪留职的工龄，在特定条件下可以算作有毒有害的工龄。具体分析如下：

一. 工龄折算原则

• 有毒有害工种的工龄折算，主要是基于员工在有毒有害环境中工作的实际年限，以及接触有害物质的种类、浓度等因素进行。
• 停薪留职期间，虽然员工没有实际领取工资，但如果其档案仍然保留在原单位，且该期间被单位认可为有毒有害工种的工作年限，那么这段期间应计入有毒有害的工龄。

二. 具体规定与操作

1. 档案记录：职工档案是认定特殊工种工作年限的关键证据。停薪留职期间，如果档案中明确记录了该段时间为有毒有害工种的工作年限，且该记录被单位和人社部门认可，那么这段期间应计入工龄。
2. 政策差异：不同地区对特殊工种工龄计算的具体政策可能存在差异。在某些地区，停薪留职期间可能不被计入有毒有害的工龄，因此具体还需咨询当地人力资源和社会保障部门以获取准确信息。

三. 实例说明

• 假设某员工在化工企业从事有毒有害工种工作，后因个人原因申请停薪留职一年。如果该员工的档案中明确记录了这一年的停薪留职期间为有毒有害工种的工作年限，且该记录被单位和人社部门认可，那么这一年在计算退休工龄或养老保险缴费年限时，应被计入有毒有害的工龄。

综上所述，有毒有害工种停薪留职的工龄，在档案记录明确且被单位和人社部门认可的情况下，可以算作有毒有害的工龄。但具体还需根据当地政策规定和实际情况来确定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。