针对“违法用地超过二年怎么处理”的问题，首先需要明确的是，无论是违法建筑还是临时使用土地超过规定期限，都将被视为违法行为，并可能面临一系列的法律后果。以下是对这一问题的详细解答：

一、违法建筑的处理

对于超过两年期限的违章建筑物，处理方式通常如下：

1. 公示与限期拆除：

   • 相关行政机构会对违章建筑进行公示，并限定当事人在法定期限内自行拆除。
   • 若当事人未在规定时间内拆除，且未提出行政复议或行政诉讼，行政机构有权采取强制措施进行拆除。

2. 整改与罚款：

   • 若违章建筑有可能通过改正措施消除对规划实施的不良影响，行政机构会设定整改期限，并要求当事人支付建设工程造价5%至10%的罚金。
   • 若无法采取改正措施，行政机构将决定最终的拆除期限。对于无法拆除的建筑物，可能会没收其实际物品或非法收益，并处以建设工程造价10%以下的罚款。

二、临时使用土地超过两年的处理

根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，临时使用土地超过两年将面临以下处理：

1. 违法用地认定：

   • 超过规定时间未归还土地，将被认定为非法占用土地。

2. 责令限期改正与行政处罚：

   • 县级以上人民政府自然资源主管部门会责令违法者限期改正，要求恢复土地原状或按合法方式继续使用。
   • 根据情节轻重，可能会对违法者处以罚款，并依法收回土地使用权。若修建了永久性建筑物，这些建筑将被认定为违法建筑，需限期拆除。

3. 民事赔偿责任：

   • 若超期使用土地导致土地所有者或其他权益人经济损失，违法者需承担民事赔偿责任。

4. 刑事责任：

   • 在严重情况下，违法者还可能面临刑事责任的追究。

三、建议与补救措施

为避免上述法律后果，建议采取以下补救措施：

1. 及时咨询专业律师：了解具体的法律规定和地方政策，以及可能的法律后果。
2. 主动沟通与整改：与土地所有权人或相关政府部门进行沟通，解释情况，寻求解决方案，并按要求恢复土地原状或补办正式的土地使用手续。
3. 提前申请续期：如果临时使用土地即将到期，应提前向相关自然资源主管部门申请续期。

综上所述，处理违法用地超过两年的问题需要谨慎对待，建议及时咨询专业律师并采取相应措施，以避免不必要的法律风险和损失。