关于货物有质量问题时扣除货款的具体数额，并没有一个固定的标准或公式，而是需要根据合同的具体约定、质量问题的严重程度以及双方的协商情况来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
合同约定优先：
- 在货物买卖合同中，双方通常会就货物的质量标准、验收方式以及质量问题发生时的处理方式进行明确约定。如果合同中明确规定了因质量问题可以扣除的货款比例或金额，那么应当按照合同约定执行。
- 示例：假设合同中规定，若货物存在质量问题，买方有权扣除货款总额的10%作为赔偿。在此情况下，若货物总价为100万元，则买方可以扣除10万元货款。
质量问题严重程度：
- 如果合同中没有明确约定扣除货款的具体数额，那么需要根据质量问题的严重程度来评估。轻微的质量问题可能只涉及少量的货款扣除，而严重的质量问题则可能导致大量货款甚至全部货款的扣除。
- 评估因素：包括但不限于质量问题的性质（如是否影响使用、是否构成安全隐患等）、对买方造成的损失大小以及修复或更换货物的成本等。
双方协商：
- 在实际操作中，当货物出现质量问题时，双方往往会通过协商来解决。协商的结果可能涉及货款扣除的数额、修复或更换货物的方案以及后续合作的方式等。
- 协商技巧：建议双方在协商过程中保持冷静和理性，充分听取对方的意见和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。
法律救济途径：
- 如果双方无法就货款扣除的数额达成一致，或者一方认为另一方的行为违反了合同约定或法律规定，那么可以通过法律途径来解决纠纷。
- 法律程序：包括但不限于向法院提起诉讼、申请仲裁等。在法律程序中，法院或仲裁机构会根据合同约定、法律规定以及双方提供的证据来裁决货款扣除的数额。
法律建议：
- 在签订货物买卖合同时，建议双方就货物的质量标准、验收方式以及质量问题发生时的处理方式进行明确约定，以避免后续纠纷的发生。
- 当货物出现质量问题时，建议双方首先通过协商来解决。如果协商无果，可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。
- 在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。
可能后果：
- 如果买方未经卖方同意擅自扣除货款，可能构成违约行为，需要承担相应的违约责任。
- 如果卖方提供的货物确实存在质量问题，且买方能够证明因此遭受了损失，那么卖方可能需要承担赔偿责任。
总结：货物有质量问题时扣除货款的数额并不是固定的，而是需要根据合同约定、质量问题的严重程度以及双方的协商情况来确定。在处理此类问题时，建议双方保持冷静和理性，通过协商或法律途径来寻求解决方案。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。