公司库房亏损并不都算在盗窃罪里。以下是对此问题的详细分析：
一、盗窃罪的构成要件
首先，我们需要明确盗窃罪的构成要件。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，盗窃罪是指以非法占有为目的，秘密窃取公私财物数额较大或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃公私财物的行为。其核心在于“非法占有目的”和“秘密窃取行为”。
二、公司库房亏损的多种可能性
公司库房亏损可能由多种原因造成，包括但不限于：
- 管理不善：如库存管理混乱、货物丢失未及时发现等。
- 员工疏忽或错误：如员工在搬运、存储过程中造成的货物损坏或丢失。
- 外部因素：如自然灾害、盗窃、抢劫等。
- 内部盗窃：即员工利用职务之便，秘密窃取公司财物。
三、公司库房亏损与盗窃罪的关系
非盗窃原因导致的亏损：
- 如果公司库房亏损是由于管理不善、员工疏忽或错误、自然灾害等非盗窃原因造成的，那么这些亏损显然不能算作盗窃罪。
盗窃原因导致的亏损：
- 如果公司库房亏损是由于内部员工或外部人员秘密窃取公司财物造成的，且符合盗窃罪的构成要件（即具有非法占有目的和秘密窃取行为），那么这部分亏损可以视为盗窃罪的后果。但需要注意的是，盗窃罪的认定需要依据具体的证据和事实，不能仅凭亏损就断定是盗窃罪。
四、法律建议
对于公司：
- 应加强库存管理，完善货物进出库制度，定期盘点库存，及时发现并处理亏损问题。
- 如发现内部员工有盗窃行为，应及时报警并配合警方调查，同时加强内部监控和防范措施。
对于员工：
- 应遵守公司规章制度，不得利用职务之便秘密窃取公司财物。
- 如发现公司有管理不善或员工盗窃行为，应及时向公司管理层或相关部门报告。
对于涉嫌盗窃的员工：
- 如果被指控涉嫌盗窃，应积极配合警方调查，如实陈述事实，提供相关证据。
- 如有需要，可以聘请专业律师进行辩护，维护自己的合法权益。
总结：公司库房亏损并不都算在盗窃罪里，其性质取决于亏损的具体原因。如果亏损是由于非盗窃原因造成的，那么不能算作盗窃罪；如果亏损是由于盗窃行为造成的，且符合盗窃罪的构成要件，那么可以视为盗窃罪的后果。但无论如何，都需要依据具体的证据和事实进行认定。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。