针对您提出的“农村建房违反协议怎么处理”的问题，这是一个涉及合同违约和法律责任的问题，我将结合相关法律法规和实际操作流程，为您详细解答。
首先，当农村建房过程中出现违反协议的情况时，我们首先要明确的是，这种行为属于合同违约。根据合同法的相关规定，违约方需要承担相应的法律责任。那么，具体应该如何处理呢？
一、友好协商
在发现违约情况后，建议双方首先进行友好协商。通过沟通，明确违约的具体情况、责任归属以及解决方案。如果双方能够达成新的共识，那么可以继续履行合同，或者对原合同进行修改和补充。
二、依据合同约定处理
如果协商无果，那么就需要依据合同中的约定来处理。合同中通常会包含关于违约责任的条款，比如违约金、赔偿损失等。如果合同中有仲裁条款，那么可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁结果具有法律效力，一旦生效，可以申请法院强制执行。
三、向法院起诉
如果合同中没有仲裁条款，或者双方对仲裁结果不满意，那么可以向当地法院提起诉讼。在起诉前，需要收集充分的证据来证明对方的违约行为以及自己因此遭受的损失。这些证据可以包括合同文本、施工记录、沟通凭证、照片、视频等。法院将根据事实和法律进行判决，违约方需要承担相应的法律责任，包括继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等。
四、法律责任的具体承担
在农村建房违约的情况下，违约方可能需要承担的法律责任包括：
民事赔偿责任：如果违约行为给对方造成了经济损失，比如因延误工期导致的额外租房费用、因质量问题导致的修复费用等，违约方需要赔偿这些损失。
继续履行责任：如果违约行为可以通过继续履行来弥补，比如房屋质量瑕疵可以修复，那么守约方有权要求违约方按照合同约定继续完成建房义务。
违约金责任：如果合同中约定了违约金条款，那么违约方需要依约支付违约金。如果违约金数额过高或过低，当事人可以请求法院或仲裁机构适当调整。
五、注意事项
在处理农村建房违约问题时，还需要注意以下几点：
妥善保管证据：在建房过程中，要妥善保管所有与建房事宜有关的各类证据，包括合同文件、付款凭证、施工记录、沟通凭证等。这些证据在争议解决阶段将起到至关重要的作用。
及时采取行动：一旦发现违约行为，要及时采取行动，避免损失扩大。同时，也要注意在法律规定的时效期内提起诉讼或申请仲裁。
寻求专业帮助：如果对法律程序不熟悉或者争议较为复杂，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和代理服务，帮助您更好地维护自己的合法权益。
综上所述，农村建房违反协议的处理方式主要包括友好协商、依据合同约定处理、向法院起诉以及承担相应的法律责任。在处理过程中，要注意妥善保管证据、及时采取行动并寻求专业帮助。希望这些解答能够对您有所帮助。