针对您提出的“建了20年的无证羊圈地基纠纷怎么处理”这一问题，结合您提供的参考信息，以下是我为您整理的详细解答：
一、纠纷背景与性质
首先，需要明确的是，您所描述的纠纷属于宅基地使用权及相邻关系纠纷。这类纠纷通常涉及土地使用权的归属、边界划分以及相邻方之间的权益平衡。由于羊圈是无证建设，且已存在20年，这增加了纠纷的复杂性和处理难度。
二、处理步骤与建议
收集证据：
- 收集与羊圈建设、使用相关的所有证据，包括但不限于建设时间、地点、尺寸、使用情况等。
- 收集宅基地使用权证、土地规划图等相关文件，以证明您的宅基地使用权范围。
- 如有必要，可请专业机构进行土地测绘，以明确边界。
协商调解：
- 尝试与对方进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 可以邀请村干部、人民调解员或法律顾问等第三方参与调解，以增加调解的公正性和有效性。
法律途径：
- 如果协商调解无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷。
- 向当地人民法院提起民事诉讼，要求对方拆除无证羊圈或赔偿损失。
- 在诉讼过程中，提供充分的证据支持您的主张，并遵循法院的判决或调解结果。
借助专业力量：
- 参考您提供的案例，可以聘请村法律顾问或专业律师提供法律意见和帮助。
- 他们可以协助您收集证据、准备诉讼材料、参与调解或诉讼过程等。
三、注意事项
保持冷静与理性：
- 在处理纠纷过程中，保持冷静和理性至关重要。
- 避免情绪化行为或言语，以免加剧矛盾。
尊重法律与程序：
- 无论选择协商调解还是法律途径，都应尊重法律和程序。
- 遵循相关法律法规和诉讼程序，以确保您的权益得到合法保护。
考虑长远利益：
- 在处理纠纷时，不仅要考虑当前利益，还要考虑长远利益。
- 寻求一个对双方都有利、能够促进邻里和谐的解决方案。
四、案例借鉴
参考您提供的南召县案例，可以看出通过法律顾问和人民调解员的介入，以及充分的证据收集和法律意见提供，最终成功化解了近20年的邻里纠纷。这为您处理类似纠纷提供了有益的借鉴和启示。
综上所述，处理建了20年的无证羊圈地基纠纷需要综合考虑多种因素，包括收集证据、协商调解、法律途径以及借助专业力量等。希望以上建议能够对您有所帮助。