债务加入人与债权人达成还款协议但未履行时，诉讼时效的计算需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若还款协议未约定履行期限
   根据《民法典》第188条及司法解释，诉讼时效自债权人知道或应当知道权利受损之日起算。在债务加入场景中，若还款协议未明确履行期限，债权人可随时要求债务加入人履行，此时诉讼时效从债权人首次主张权利（如催告还款）且债务加入人明确拒绝履行时起算，最长不超过20年（自权利产生之日起）。
   法律依据：《民法典》第188条（诉讼时效期间）、第195条（权利人主张权利导致时效中断）。

2. 若还款协议约定了履行期限
   诉讼时效自履行期限届满之日起算3年。若债务加入人未按约履行，债权人需在期限届满后3年内提起诉讼或仲裁，否则可能丧失胜诉权。
   例外情形：若债务加入人在履行期限届满前明确表示不履行，或通过行为表明不履行（如转移财产），债权人可提前主张权利，诉讼时效从其明确拒绝或行为表明不履行时起算。
   法律依据：《民法典》第188条、第192条（诉讼时效届满后果）。

3. 诉讼时效中断的特殊情形
   若债权人在诉讼时效期间内通过以下方式主张权利，时效中断并重新计算3年：

   • 向债务加入人发出书面催款通知（需保留送达证据）；
     
   • 提起诉讼或申请仲裁；
     
   • 债务加入人同意履行（如签署还款计划）。
     法律依据：《民法典》第195条。

实务建议：

• 债权人应固定还款协议、催款记录等证据，避免因证据缺失导致时效风险；
  
• 若债务加入人未履行，建议及时通过书面形式催告并留存凭证，或直接启动法律程序；
  
• 债务加入人可主张诉讼时效抗辩，但需在答辩阶段明确提出，否则可能视为放弃。
  

如有具体协议条款或履行细节需分析，可进一步提供信息，我将结合协议内容细化时效计算节点。