投标公司与发标单位曾有过合作，在法律层面并不直接构成投标禁止情形，但需结合具体情形判断合规性。以下从不同角度展开分析：

1. 法律层面：无直接禁止，但需规避利益冲突

• 《招标投标法》及相关规定：我国法律未明确禁止投标人与发标单位存在历史合作关系，但要求招标过程遵循“公平、公正、公开”原则。若历史合作导致投标人在本次投标中享有不公平优势（如提前获取招标信息、技术参数等），则可能涉嫌违法。
• 关键点：需证明历史合作未影响本次投标的独立性。例如，若合作内容与本次招标项目无关，或合作已终止且无利益输送，则通常不构成违规。

2. 合规层面：需审查招标文件要求

• 招标文件限制：部分招标项目会在文件中明确限制与发标单位存在特定关系的企业参与（如“近三年内与招标人存在合同关系的企业不得投标”）。若存在此类限制，即使历史合作合法，也可能导致投标无效。
• 操作建议：投标前应仔细审查招标文件，确认无此类限制条款。如有疑问，可要求发标单位书面澄清。

3. 实践层面：需防范“围标串标”嫌疑

• 风险点：若投标人与发标单位存在长期合作关系，可能被质疑存在“量身定制”招标条件、操纵评标结果等行为。此类行为可能触犯《刑法》中的“串通投标罪”或《招标投标法》中的行政处罚条款。
• 防范措施：投标人应确保本次投标的方案、报价等完全独立于历史合作，避免使用与历史合作相关的专属技术或资源。同时，保留完整的投标文件编制记录，以备监管部门核查。

4. 特殊情形：关联方投标需额外披露

• 关联关系定义：若投标人与发标单位存在控股、管理关系（如母子公司、同一实际控制人），则属于关联方投标。根据《招标投标法实施条例》，此类情形需在投标文件中披露，否则可能面临行政处罚。
• 例外情形：若项目属于“必须进行招标的工程建设项目”，且关联方投标符合“技术复杂或有特殊要求，只有少量潜在投标人可供选择”等例外条件，则可能被允许。但需严格履行披露义务。

总结建议：

1. 确认历史合作是否涉及本次招标项目的核心技术、信息或资源，若涉及需主动规避；
   
2. 仔细审查招标文件，确认无对历史合作的限制性条款；
   
3. 保留完整的投标文件编制记录，防范串标嫌疑；
   
4. 若存在关联关系，需依法披露并评估是否符合例外条件。
   

如有具体案例或文件条款需进一步分析，可直接向我咨询。