当需要将分公司和总公司一起作为被告起诉时，管辖法院的确定需遵循以下原则和步骤：

1. 合同协议管辖优先：

   • 根据《民事诉讼法》的相关规定，如果总公司和分公司之间，或者与原告之间有明确的合同协议，并且该协议中约定了管辖法院，那么只要这个约定不违反法律的强制性规定，就应当优先按照该约定来确定管辖法院。
   • 例如，如果合同中明确约定了“因本合同产生的争议，由甲方（总公司）所在地法院管辖”，那么在起诉时，就应当向甲方（总公司）所在地法院提起诉讼。

2. 法定管辖原则：

   • 如果没有合同协议管辖，或者合同协议管辖违反了法律的强制性规定，那么就需要按照法定管辖原则来确定管辖法院。
   • 一般来说，民事诉讼由被告住所地法院管辖。在分公司和总公司一起作为被告的情况下，如果分公司具有独立的诉讼主体资格（即分公司领取了营业执照，有一定的财产和组织机构），那么分公司和总公司所在地法院都可能具有管辖权。但具体由哪个法院管辖，可能需要根据案件的具体情况、法院的管辖范围以及当事人的选择等因素来确定。
   • 如果分公司不具有独立的诉讼主体资格（即分公司未领取营业执照，或者虽然领取了营业执照但无独立的财产和组织机构），那么通常只能将总公司作为被告，并由总公司所在地法院管辖。不过，在实际操作中，如果案件与分公司有直接关联，且分公司有实际经营场所，原告也可能会选择向分公司所在地法院提起诉讼，此时法院可能会根据案件的具体情况来决定是否受理。

3. 特殊地域管辖：

   • 对于某些特定类型的案件，如合同纠纷、侵权纠纷等，法律还规定了特殊的地域管辖原则。例如，合同纠纷可能由合同履行地或者被告住所地法院管辖；侵权纠纷可能由侵权行为地或者被告住所地法院管辖。
   • 在分公司和总公司一起作为被告的情况下，如果案件涉及特殊地域管辖的规定，那么还需要考虑这些规定对管辖法院确定的影响。

4. 实际操作建议：

   • 在确定管辖法院时，建议原告先仔细审查合同协议管辖条款，确保没有违反法律的强制性规定。
   • 如果没有合同协议管辖或者合同协议管辖不明确，那么建议原告根据案件的具体情况、被告的住所地以及特殊地域管辖的规定等因素来综合考虑确定管辖法院。
   • 如果对管辖法院的确定有疑问或者不确定，建议原告及时咨询专业律师以获取更准确的法律建议。

总结来说，当需要将分公司和总公司一起作为被告起诉时，管辖法院的确定需综合考虑合同协议管辖、法定管辖原则以及特殊地域管辖的规定。在实际操作中，建议原告根据案件的具体情况来选择合适的管辖法院，并在必要时咨询专业律师以获取法律支持。如果有任何法律问题，都可以直接向我咨询。