您好，针对您提出的“民事诉讼代理中直系亲属不在一个户口本怎么证明”的问题，这确实是一个在实际操作中可能会遇到的情况。为了证明非同一户口簿上的直系亲属关系，您可以通过以下途径来获取相关证明：

一、前往当地派出所办理亲属关系证明

这是最为直接和有效的方式。您可以携带本人身份证、直系亲属的身份证（如果可能的话）以及其他能证明亲属关系的材料（如出生证明、结婚证、过往的户籍记录等），前往当地派出所的户政窗口申请开具亲属关系证明。派出所会根据您提供的材料进行核实，并出具相应的证明文件。

二、利用线上平台办理

现在，很多地区都推出了线上政务服务平台，如“警快办”等，这些平台提供了开具亲属关系证明的在线服务。您可以通过这些平台的官方网站或手机APP，按照提示进行操作，上传相关材料，完成在线申报。这种方式方便快捷，可以节省您的时间和精力。

具体办理步骤（以线上平台为例）：

1. 登录平台：首先，您需要登录到当地的线上政务服务平台，如“警快办”。

2. 进入户政专区：在平台首页或菜单中，找到“户政专区”或类似的入口，点击进入。

3. 选择开具证明服务：在户政专区中，找到“其他户口登记服务事项”或类似的选项，然后选择“开具户籍类证明”。

4. 申请开具亲属关系证明：在开具户籍类证明的页面中，找到并点击“开具亲属关系证明”的选项。

5. 填写信息并上传材料：按照页面提示，填写您和直系亲属的相关信息，并上传能证明亲属关系的材料。

6. 提交申请并等待审核：确认信息无误后，提交申请。平台会对您的申请进行审核，审核通过后，会出具亲属关系证明。

三、注意事项

• 在办理过程中，请确保提供的材料真实有效，以免因材料不实而导致申请被拒。
• 如果您对办理流程或所需材料有疑问，可以提前咨询当地派出所或线上平台的客服人员。
• 亲属关系证明一旦出具，请妥善保管，以备后续使用。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。