诽谤案件的管辖部门主要依据案件性质而定，一般分为自诉案件和公诉案件两种情况，具体如下：
一、自诉案件：由人民法院直接管辖
诽谤罪在大多数情况下属于自诉案件，即需要被害人自行向人民法院提起诉讼。根据《中华人民共和国刑法》第二百四十六条的规定，以暴力或者其他方法公然侮辱他人或者捏造事实诽谤他人，情节严重的，构成诽谤罪。在此类案件中，被害人需要准备充分的证据，如网络言论截图、证人证言等，以证明对方实施了诽谤行为，并且该行为足以贬损其人格、名誉，情节严重。
诉讼流程：
- 收集证据：确保所收集的证据真实、合法且与案件相关。
- 撰写刑事自诉状：详细描述诽谤行为发生的时间、地点、方式等，并提出具体的诉讼请求。
- 向有管辖权的法院提起诉讼：一般是犯罪地的人民法院，如果由被告人居住地的人民法院审判更为适宜的，也可由被告人居住地的人民法院管辖。
- 法院审查与受理：法院会对提交的材料进行审查，符合立案条件的，予以受理；不符合的，会说明理由并退回材料。
- 参加庭审：立案后，按照法院的安排参加庭审，在庭审中陈述事实、出示证据，进行辩论等。
- 法院判决：最终由法院依据事实和法律作出判决。
二、公诉案件：由公安机关管辖，最终由法院审判
在特定情况下，如诽谤行为严重危害社会秩序和国家利益时，诽谤罪可能转化为公诉案件。此时，公安机关将负责立案侦查，收集相关证据，并在侦查结束后将案件移送至检察机关进行审查起诉。如果检察机关决定提起公诉，案件将由法院进行审理，并依据相关证据和法律规定判定被告人的行为是否构成诽谤罪，然后作出相应的判决。
公安机关的侦查流程：
- 接受报案：公安机关会对报案予以审查，若觉得有犯罪事实且需追究刑责，便会立案侦查。
- 侦查活动：在侦查期间，公安机关会搜集证据、询问证人等，以认定犯罪事实。
- 移送审查起诉：侦查结束后，公安机关会把案件移送至检察机关进行审查起诉。
三、特别提醒
- 证据的重要性：无论是自诉案件还是公诉案件，证据都是关键。被害人需要确保所收集的证据充分、真实、合法，以支持其诉讼请求。
- 法律程序的遵循：在提起诉讼或报案时，被害人需要遵循法律程序，确保每一步都符合法律规定。
- 民事赔偿的考虑：除了刑事责任外，被害人还可以考虑通过民事诉讼要求被告人承担民事赔偿责任，如赔偿精神损害抚慰金等。
若您遭遇了诽谤情况，可以根据上述流程选择合适的途径进行维权。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。