以发货来确认收入并核对收货，在法律上并非绝对不合法，但其合法性及具体操作需结合合同条款、交易习惯及税法规定综合判断。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、合同条款的约定

1. 合同自主性：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方有权在合同中约定收入确认的方式和时间。因此，如果货物买卖合同中明确约定了以发货作为收入确认的时点，并且买方也同意此条款，那么按照发货确认收入并核对收货是合法的。

2. 条款明确性：合同中应明确发货与收入确认的具体关系，例如是否以发货单作为收入确认的依据，以及收货核对在收入确认过程中的作用。如果合同条款模糊不清，可能导致双方在执行过程中产生争议。

二、交易习惯与行业惯例

1. 交易习惯：在某些行业中，按照发货确认收入是一种常见的交易习惯。例如，在电商行业中，由于物流速度较快，且买方通常会在收到货物后进行确认，因此卖方可能会选择以发货作为收入确认的时点。然而，这种习惯并不适用于所有行业或所有交易场景。

2. 行业惯例：不同行业可能有不同的收入确认惯例。在某些行业中，可能更注重实际收货情况，因此会将收货作为收入确认的关键时点。因此，在判断以发货确认收入并核对收货的合法性时，需要考虑所在行业的惯例。

三、税法规定

1. 增值税纳税义务发生时间：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则的规定，增值税纳税义务发生时间通常为销售方发出货物的当天（有书面合同约定的按合同，无书面合同或书面合同没有约定收款日期的为货物发出的当天）。然而，如果合同或交易习惯中明确以收货作为收入确认的时点，并且得到了税务机关的认可，那么也可以按照收货时间确认收入。

2. 所得税收入确认：对于企业所得税而言，收入的确认通常遵循权责发生制原则。这意味着，收入应在经济利益很可能流入企业且收入的金额能够可靠地计量时确认。因此，如果以发货作为收入确认的时点，需要确保此时点符合权责发生制原则的要求。

四、实际操作中的注意事项

1. 核对收货的重要性：即使合同中约定了以发货作为收入确认的时点，卖方仍应关注买方的收货情况。如果买方未收到货物或收到的货物存在质量问题，可能会导致买方拒绝付款或要求退货，从而影响卖方的收入确认和资金回笼。

2. 风险防范措施：为了降低风险，卖方可以在合同中约定买方在收到货物后的一定期限内进行确认，并明确如果买方未在此期限内提出异议，则视为已收货并同意支付货款。此外，卖方还可以考虑购买相关的保险或采取其他风险防范措施。

五、可能的法律后果

1. 合同纠纷：如果合同中未明确约定以发货作为收入确认的时点，或者约定不明确，双方可能会因此产生争议并引发合同纠纷。

2. 税务风险：如果卖方未按照税法规定的时间确认收入，可能会面临税务机关的处罚或调整。例如，如果卖方提前确认了收入而实际上买方尚未收货或付款，可能会导致增值税和企业所得税的计税依据不准确。

建议：在实际操作中，卖方应谨慎选择收入确认的时点，并确保合同条款明确、交易习惯合理、税法规定得到遵守。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。