结论：门店有法人但店长并非法人而进行签字，是否产生影响需视具体情况而定，可能涉及合同效力、公司内部管理规定及法律责任等多个方面。

一、合同效力层面

1. 若店长有合法授权：

   • 若店长虽非法人，但获得了公司或法人的明确授权（如书面授权书、公司章程规定等），则其签字行为可视为公司行为，合同对门店具有法律约束力。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于代理的规定，被代理人对代理人的代理行为，承担民事责任。

2. 若店长无合法授权：

   • 若店长未经授权擅自签字，则该签字行为可能构成无权代理，合同效力待定。此时，若公司或法人未追认，则合同对门店不产生法律约束力。
   • 法律后果：无权代理人实施的民事法律行为，未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。但是，相对人有理由相信行为人有代理权的，代理行为有效（表见代理）。

二、公司内部管理规定层面

1. 公司章程或内部规定：

   • 若公司章程或内部管理规定明确规定了签字权限和程序，店长未经法人同意擅自签字可能违反公司规定，导致内部管理纠纷。
   • 建议：公司应完善内部管理规定，明确签字权限和程序，避免类似纠纷发生。

2. 公司治理结构：

   • 在公司治理结构中，法人通常代表公司行使权利、履行义务。店长作为管理人员，其签字行为应符合公司治理结构的要求。
   • 风险提示：若店长签字行为违反公司治理结构，可能引发公司内部矛盾，甚至影响公司正常运营。

三、法律责任层面

1. 店长个人责任：

   • 若店长未经授权擅自签字，且给公司或第三方造成损失，店长可能需承担个人责任，包括赔偿损失等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。

2. 公司责任：

   • 若公司对店长签字行为存在管理过失（如未明确授权、未监督签字行为等），公司可能需承担一定的管理责任。
   • 风险提示：公司应加强对管理人员的培训和监督，确保签字行为符合法律法规和公司规定。

四、实际操作建议

1. 明确授权：公司应明确授权范围和程序，确保签字行为有法可依、有章可循。
2. 完善内部管理：公司应完善内部管理规定，明确签字权限和程序，避免内部管理纠纷。
3. 加强培训：公司应加强对管理人员的法律培训，提高其法律意识和风险防范能力。
4. 及时追认或否认：若发生无权代理情况，公司应及时追认或否认签字行为，以避免法律纠纷。

总结：门店有法人但店长并非法人而进行签字，是否产生影响需根据具体情况判断。为避免法律纠纷和内部管理问题，公司应明确授权范围和程序、完善内部管理规定、加强培训并及时处理无权代理情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。