在农民起诉行政案件中，一般是由行政机关承担举证责任，而非农民或相关部门直接举证。以下是对此问题的详细分析：
一、行政诉讼中的举证责任原则
在行政诉讼中，举证责任通常遵循“被告负举证责任”的原则。这意味着，作为被告的行政机关需要提供证据来证明其行政行为的合法性。这一原则源于《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，旨在保护相对弱势的原告（如农民）的合法权益，防止行政机关滥用权力。
二、农民作为原告的举证责任
虽然行政机关承担主要的举证责任，但农民作为原告，在特定情况下也需要承担一定的举证责任。这主要包括：
证明起诉符合法定条件：农民需要证明其起诉符合法律规定的起诉条件，如具有原告资格、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实根据等。
提供初步证据：在起诉时，农民可能需要提供一些初步证据来支持其诉讼请求，如行政机关作出的具体行政行为文书、相关权益受到侵害的证据等。这些证据有助于法院受理案件并初步判断案件的合法性。
在行政机关不作为案件中举证：如果农民起诉的是行政机关不作为（如未履行法定职责），则需要证明其曾向行政机关提出申请，且行政机关未履行相应职责。
三、行政机关的举证责任
行政机关作为被告，需要承担证明其行政行为合法性的举证责任。这包括：
提供作出行政行为的证据和所依据的规范性文件：行政机关需要提交其作出行政行为时所依据的事实证据和法律、法规、规章等规范性文件。
证明行政行为的合法性：行政机关需要证明其行政行为在程序上合法、在实体上符合法律规定，且没有滥用职权或超越职权的情况。
四、举证责任转移与特殊情况
在某些特殊情况下，举证责任可能会发生转移。例如，如果行政机关能够证明原告的起诉缺乏事实根据或法律依据，或者原告的诉讼请求明显不合理，那么举证责任可能会部分或全部转移给原告。然而，这种情况在行政诉讼中相对罕见。
五、法律建议
对于农民而言，在起诉行政案件时，应充分了解自己的举证责任，并尽可能收集相关证据来支持自己的诉讼请求。同时，也可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
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