股东和房东私自达成协议是否违法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 协议内容与公司利益的关系：

   • 若协议损害公司利益：股东作为公司的投资者和利益相关者，其行为应当以公司利益为出发点。如果股东与房东私自达成的协议，如低价租赁、长期免租等，明显损害了公司的利益，那么这种行为可能构成对公司利益的侵害，违反了股东对公司应负的忠实义务。在此情况下，公司或其他股东有权要求该股东承担赔偿责任，甚至可能通过法律途径追究其法律责任。
   • 若协议未损害公司利益：如果股东与房东达成的协议并未损害公司的利益，例如是正常的租赁条件调整，且符合市场行情，那么这种行为可能并不违法。但即便如此，股东也应当确保其行为符合公司章程和内部管理制度的要求，避免引发不必要的纠纷。

2. 协议是否违反公司章程或内部管理制度：

   • 违反公司章程或制度：公司章程是公司的“宪法”，规定了公司的组织结构、管理方式、股东权利与义务等重要事项。如果股东与房东私自达成的协议违反了公司章程或内部管理制度的规定，如未经董事会或股东会批准擅自签订租赁合同，那么这种行为可能构成违约或违规，需要承担相应的法律责任。
   • 不违反公司章程或制度：如果协议内容并未违反公司章程或内部管理制度的规定，那么从公司内部管理的角度来看，这种行为可能并不违法。但股东仍需注意，其行为不得损害公司或其他股东的利益。

3. 协议是否涉及非法行为：

   • 涉及非法行为：如果股东与房东私自达成的协议涉及非法行为，如行贿、受贿、洗钱等，那么这种行为显然是违法的，不仅可能面临刑事处罚，还可能对公司造成严重的负面影响。
   • 不涉及非法行为：如果协议内容合法合规，不涉及任何非法行为，那么从法律的角度来看，这种行为并不违法。但股东仍需谨慎行事，确保其行为符合法律法规和道德规范的要求。

法律建议：

• 股东在与房东达成任何协议前，应当充分了解公司章程和内部管理制度的规定，确保其行为符合公司利益和管理要求。
• 如果协议内容可能涉及公司重大利益或存在不确定性，股东应当事先征求公司董事会或股东会的意见，确保决策的合法性和合规性。
• 股东应当遵守法律法规和道德规范的要求，不得利用与房东的协议进行非法活动或损害公司及其他股东的利益。

可能的法律后果：

• 如果股东与房东私自达成的协议违反了法律法规、公司章程或内部管理制度的规定，或者损害了公司及其他股东的利益，那么该股东可能需要承担民事责任（如赔偿损失）、行政责任（如罚款）甚至刑事责任（如涉及犯罪行为）。

因此，股东在与房东达成协议时应当谨慎行事，确保行为的合法性和合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。