农民工工资几个月一起发且超过5000元的情况，首先需要明确的是，无论工资总额多少或发放周期如何，用人单位都应当按时足额支付农民工工资，不得拖欠或克扣。针对您提出的问题，我将从法律角度进行全面分析：

1. 工资支付周期与法律规定

• 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。” 这意味着，用人单位应当每月至少支付一次工资，且支付周期不得超过一个月。
• 如果用人单位将几个月的工资一起发放，且超过了法定的支付周期，这可能构成拖欠工资的行为，即使总额超过5000元也不例外。

2. 工资总额与税务问题

• 工资总额超过5000元，可能涉及个人所得税的缴纳问题。根据《中华人民共和国个人所得税法》，工资、薪金所得属于个人所得税的征税范围。但税务问题与工资支付周期是两个独立的问题，不能因工资总额高而忽视支付周期的合法性。
• 用人单位应依法代扣代缴个人所得税，但这并不改变其按月支付工资的法律义务。

3. 农民工工资的特殊保护

• 农民工作为弱势群体，其工资权益受到法律的特别保护。根据《保障农民工工资支付条例》，用人单位应当按照与农民工书面约定或者依法制定的规章制度规定的工资支付周期和具体支付日期足额支付工资。
• 如果用人单位违反规定，拖欠农民工工资，农民工有权向劳动监察部门投诉，要求用人单位支付拖欠的工资，并可能面临相应的法律责任。

4. 可能的法律后果

• 如果用人单位拖欠农民工工资，劳动行政部门可以责令其限期支付；逾期不支付的，可以责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
• 此外，用人单位还可能面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等，甚至可能构成拒不支付劳动报酬罪，承担刑事责任。

5. 建议与行动

• 如果您作为农民工遇到工资被几个月一起发且超过5000元的情况，首先应当与用人单位沟通，要求其按月支付工资。
• 如果沟通无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，寻求法律帮助。
• 同时，保留好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以便在维权时提供有力支持。

总结来说，无论工资总额多少或发放周期如何，用人单位都应当按时足额支付农民工工资。如果遇到拖欠工资的情况，农民工有权依法维权。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。