结论：甲方要求技术员赔偿是否合法，需根据具体情况判断，包括技术员是否存在过错、过错与损失之间的因果关系以及合同中的相关约定等。
一、从过错责任角度分析
技术员是否存在过错：
- 技术员在工地正负零标高做低90公分的过程中，如果其操作符合行业规范、技术标准以及甲方的明确要求，且没有故意或重大过失导致该结果，那么技术员通常不应承担赔偿责任。
- 如果技术员在操作过程中存在疏忽、错误判断或违反操作规程等行为，导致正负零标高做低，且该行为与损失之间存在直接因果关系，那么技术员可能需要承担相应的赔偿责任。
过错与损失之间的因果关系：
- 即使技术员存在过错，也需要证明该过错与甲方所遭受的损失之间存在直接的因果关系。如果损失是由其他因素（如设计错误、材料问题、施工环境等）导致的，那么技术员可能不应承担全部或部分赔偿责任。
二、从合同约定角度分析
合同中的责任条款：
- 如果甲方与技术员或其所在单位签订的合同中明确规定了正负零标高的具体要求以及违反该要求的赔偿责任，那么双方应按照合同约定执行。
- 如果合同中没有明确规定或规定不明确，那么需要根据相关法律法规和行业惯例来判断责任归属。
合同履行过程中的变更与协商：
- 在合同履行过程中，如果双方对正负零标高进行了变更或协商，且该变更或协商得到了双方的认可，那么技术员可能不需要承担因变更或协商导致的损失赔偿责任。
三、从法律原则角度分析
公平原则：
- 在判断技术员是否应承担赔偿责任时，应遵循公平原则，即根据双方的过错程度、损失大小以及实际情况等因素来合理分配责任。
损失填补原则：
- 如果技术员需要承担赔偿责任，那么其赔偿金额应以填补甲方的实际损失为限，不应超过损失的实际范围。
四、建议与措施
收集证据：
- 甲方应收集相关证据，如施工图纸、技术规范、操作记录、损失评估报告等，以证明技术员存在过错以及该过错与损失之间的因果关系。
协商与调解：
- 在发生争议后，双方可以尝试通过协商或调解的方式解决争议，以达成双方都能接受的解决方案。
法律途径：
- 如果协商或调解无果，甲方可以通过法律途径（如诉讼或仲裁）来维护自己的合法权益。
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